258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2682 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  290  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  53.1 
 
 		 146 aa  156  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  51.02 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  48.3 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  49.32 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  48.98 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  51.02 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  49.66 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  49.66 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  51.02 
 
 		 148 aa  146  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  51.02 
 
 		 148 aa  146  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  50.34 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  49.32 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  52.05 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  49.32 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  49.32 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  49.32 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  50.68 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  47.62 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  46.94 
 
 		 147 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  47.3 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  47.59 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  49.66 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  47.97 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  47.97 
 
 		 148 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  48.3 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  47.26 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  47.26 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  45.89 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  47.62 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  46.94 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  47.95 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  51.02 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  45.89 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  48.92 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  47.59 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  45.89 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  44.22 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  48.98 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  44.59 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  47.26 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  47.95 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  45.75 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  43.15 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  46.26 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  46 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  48.3 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  47.3 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  44.59 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  44.52 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  46.62 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  48.63 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  43.54 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  44.52 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  43.75 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  44.52 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  46.21 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  47.62 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  46.58 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  47.62 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  45.27 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  44.67 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  45.64 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  42.47 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  47.59 
 
 		 152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  44.83 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  49.32 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  45.21 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  43.92 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  43.92 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  44.9 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  45.58 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  46.94 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  43.62 
 
 		 178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  43.84 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  43.33 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  43.42 
 
 		 513 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  42.07 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  42.18 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  43.06 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>