257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0826 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  294  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  75.5 
 
 
152 aa  224  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  66.23 
 
 
152 aa  197  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  62.25 
 
 
152 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  62.25 
 
 
151 aa  186  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  62.25 
 
 
152 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  60.93 
 
 
152 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  56.95 
 
 
151 aa  168  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  52.7 
 
 
513 aa  158  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  49.01 
 
 
157 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  49.01 
 
 
148 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  47.02 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  43.05 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  49.66 
 
 
150 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  42.38 
 
 
147 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  43.05 
 
 
148 aa  123  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  46.79 
 
 
153 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  43.71 
 
 
149 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  46.36 
 
 
150 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  40.4 
 
 
148 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  46.67 
 
 
148 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  44 
 
 
149 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  42.67 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  43.05 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  42.38 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  46.36 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  40.67 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  46.76 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.57 
 
 
149 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  46.1 
 
 
149 aa  117  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  42.28 
 
 
152 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  43.71 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  43.71 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  41.06 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  42.38 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  45.03 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  41.1 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  40.41 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  40.41 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  40.41 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.61 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  45.58 
 
 
147 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  40 
 
 
153 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  46.48 
 
 
148 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  41.33 
 
 
147 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  39.73 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  47.02 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  45.33 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  39.73 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  40.4 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42.38 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  43.07 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  42.86 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  42 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  44.37 
 
 
148 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  38 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  40.67 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 
149 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  38 
 
 
152 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  37.09 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  40.13 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  43.71 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  40.27 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  40.82 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  42.28 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0528  hypothetical protein  44.37 
 
 
148 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  41.72 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  39.04 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  38.41 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  41.72 
 
 
150 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  37.09 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.09 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 
148 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  41.33 
 
 
147 aa  105  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.41 
 
 
147 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2348  GatB/YqeY domain-containing protein  47.44 
 
 
153 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0884151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  36.67 
 
 
152 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 
149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  40.94 
 
 
150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  38.41 
 
 
147 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  37.75 
 
 
151 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 
151 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.06 
 
 
147 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  39.07 
 
 
148 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 
145 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>