259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0238 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  284  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  93.29 
 
 
149 aa  269  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  52.7 
 
 
149 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  54.05 
 
 
147 aa  153  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  51.72 
 
 
148 aa  149  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  52.67 
 
 
150 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  44.22 
 
 
150 aa  146  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  52.38 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  45.27 
 
 
148 aa  141  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  49.31 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  45.89 
 
 
147 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  47.95 
 
 
148 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  48.61 
 
 
146 aa  135  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  47.3 
 
 
148 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  45.14 
 
 
147 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  46.53 
 
 
145 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  45.77 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  42.57 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  47.92 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  49.34 
 
 
513 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  46.62 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  47.26 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  46.31 
 
 
147 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  43.24 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  43.79 
 
 
173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  46.31 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  44.06 
 
 
147 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  49.66 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  42.66 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  42.66 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  44.59 
 
 
148 aa  126  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.06 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  42.66 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  43.84 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  41.89 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  42.18 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  41.38 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  43.84 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  43.84 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  43.84 
 
 
147 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  43.15 
 
 
147 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  43.15 
 
 
147 aa  124  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  41.42 
 
 
173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  45.27 
 
 
143 aa  124  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  123  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  42.47 
 
 
147 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  43.54 
 
 
147 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  39.73 
 
 
147 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  44.76 
 
 
147 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  47.3 
 
 
150 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  42.96 
 
 
147 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  45.21 
 
 
167 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.55 
 
 
151 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  45.39 
 
 
152 aa  120  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  50.69 
 
 
143 aa  120  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  48 
 
 
157 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  45.89 
 
 
147 aa  120  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  41.96 
 
 
147 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  41.96 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  42.67 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  44.83 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  40.82 
 
 
147 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  46.98 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  46.98 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  44.59 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  47.37 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  39.16 
 
 
148 aa  115  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  41.26 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  45.89 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  45.58 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  44.22 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  40.82 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  47.65 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  44 
 
 
152 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  42.86 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.36 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.36 
 
 
148 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  37.76 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  41.06 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  46.05 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
152 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.06 
 
 
147 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  40.56 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  40.28 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  43.05 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  37.06 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>