257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0234 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  100 
 
 		 155 aa  294  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  61.94 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  57.79 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  61.44 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  57.14 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  53.9 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  55.56 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  57.79 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  57.79 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  57.79 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  58.17 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  61.29 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  54.9 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  55.19 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  56.21 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  57.14 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  53.9 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  49.66 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  56.58 
 
 		 155 aa  123  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  52.32 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  53.29 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  50.32 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  47.37 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  44.74 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  42.48 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  47.65 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  42.11 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  42.67 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  38.82 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.67 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.71 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  41.22 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  38.41 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.79 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  40.13 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.69 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  42.38 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  38.85 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  40.13 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  45.83 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  33.77 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  35.33 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  35.1 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  41.33 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.84 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  36.69 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  38.67 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  35.97 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  35.97 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  35.95 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  36.18 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  32.47 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  36.18 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  41.84 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  40.13 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  37.01 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  38.67 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  38.67 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  33.12 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  38.26 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  36.55 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  37.75 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  36.91 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.76 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  36.67 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  36.42 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  36.54 
 
 		 513 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  38.67 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  33.56 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  32.24 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  35.06 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  35.06 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  35.1 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  37.75 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  30.26 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36.6 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>