258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0535 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  279  8.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  62.5 
 
 
152 aa  161  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  59.21 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  55.63 
 
 
151 aa  148  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  54 
 
 
167 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  51.33 
 
 
154 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  52.03 
 
 
154 aa  139  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  55.33 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  55.41 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  55.41 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  55.41 
 
 
154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  54.3 
 
 
152 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  47.68 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  52.67 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  54.36 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  49.66 
 
 
155 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  51.05 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  55.78 
 
 
155 aa  123  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  44.59 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  58.33 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  50 
 
 
184 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  41.83 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  45.45 
 
 
154 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  47.33 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.62 
 
 
149 aa  110  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  39.33 
 
 
151 aa  110  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  53.33 
 
 
150 aa  107  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.6 
 
 
147 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.27 
 
 
147 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  39.33 
 
 
148 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  43.33 
 
 
149 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  36.99 
 
 
513 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  42.67 
 
 
149 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  42.67 
 
 
149 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  34.67 
 
 
148 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  46.71 
 
 
154 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  33.78 
 
 
148 aa  103  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.36 
 
 
151 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40 
 
 
146 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  38.26 
 
 
147 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  35.29 
 
 
149 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  36.73 
 
 
149 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  44.3 
 
 
143 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  38.67 
 
 
149 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 
152 aa  100  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  49.01 
 
 
160 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.58 
 
 
147 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  36.24 
 
 
147 aa  100  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  38.1 
 
 
152 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  38.36 
 
 
149 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  38.26 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  42.28 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  39.31 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  42.67 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.74 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  37.58 
 
 
147 aa  97.1  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  44 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.23 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  31.51 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.84 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.58 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.58 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  42.18 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  38.93 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  35.57 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  38.93 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 
151 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  35.57 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  36.91 
 
 
147 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  36.91 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 
147 aa  93.6  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  37.58 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 
149 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  35.57 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  39.33 
 
 
150 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  35.29 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  37.91 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  35.76 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  38.41 
 
 
158 aa  90.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  35.14 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  37.58 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  34.9 
 
 
147 aa  90.1  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  38.93 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  36.91 
 
 
147 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  32.86 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>