251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2005 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  304  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  82.24 
 
 		 153 aa  244  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  45.45 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  48.39 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  42.48 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  45.86 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  41.56 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  41.56 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  43.51 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  44.52 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  38.96 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  39.61 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  43.05 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  37.5 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.5 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  39.22 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.06 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  37.18 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  34.87 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  40.79 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  42.21 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  36.49 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  37.09 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  36.42 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  42.11 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  37.42 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  38.82 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  34.42 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  35.1 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  35.76 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  36.18 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  37.91 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  41.83 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  35.29 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  38 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  33.55 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  35.95 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  36.18 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  38.06 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  34.87 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  36.6 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  39.22 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  33.55 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.42 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  33.55 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  37.91 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  36.18 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  35.71 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  32.24 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  36.84 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  33.99 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  35.97 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  33.77 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  35.9 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  32.47 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  33.55 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  35.26 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  32.47 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  34.64 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  31.37 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  31.13 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  31.65 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  35.06 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  36.77 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  30.57 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  35.53 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  35.26 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  36.84 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  35.26 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  33.97 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  35.26 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  36.69 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  33.12 
 
 		 513 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  35.81 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  36.77 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  35.81 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>