257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5306 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  292  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  64.67 
 
 		 150 aa  188  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  64 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  67.11 
 
 		 155 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  60.67 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  60.26 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  61.07 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  55.56 
 
 		 155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  57.62 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  52.98 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  54.67 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  56.58 
 
 		 184 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  50.67 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  48.05 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  47.68 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  53.9 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  51.3 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  51.3 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  51.3 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  47.26 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  55.7 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  45.58 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  43.15 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  52.6 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  40.97 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  42.28 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  39.74 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.3 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  43.54 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  40.28 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40.82 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  37.33 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  41.5 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  36.73 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  38.19 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  40.27 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  41.22 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.54 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  38 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  39.16 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.41 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  39.33 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  40.82 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  39.46 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  39.46 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.19 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  39.33 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  42.38 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  38.51 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  38.67 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  39.16 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  36.55 
 
 		 148 aa  99.4  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  38.36 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  35.86 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  35.37 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  37.06 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  39.16 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  38.46 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.51 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  33.1 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  38.51 
 
 		 513 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  37.84 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.84 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  35.37 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  37.76 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  56 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  35.37 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  35.1 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  36.05 
 
 		 149 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  35.1 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  37.86 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  32.41 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  38 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  33.81 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  34.67 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  36.3 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4797  GatB/YqeY domain-containing protein  55.63 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  36.11 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>