254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4355 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  285  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4797  GatB/YqeY domain-containing protein  90.67 
 
 		 151 aa  173  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  58.67 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  55.63 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  56 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  58 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  58 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  52.67 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  53.33 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  60.4 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  58 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  55.56 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  56.29 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  52 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  56.38 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  52.63 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  44.16 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  54 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  50.66 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  48.05 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  48.05 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  48.05 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.33 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  48.32 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.26 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  40.54 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  45.1 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  40.82 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  38.78 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  39.46 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  38.78 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.18 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.46 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  40.94 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  35.14 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.14 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  40.82 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  43.51 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  32.65 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  33.11 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  33.33 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  31.76 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  35.66 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  39.46 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  32.43 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  36.73 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  36.18 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  31.43 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38.1 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38.1 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  34.9 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  38.78 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  34.23 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  34.46 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  39.47 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  32.62 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  37.16 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  36.42 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  38.93 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  34.46 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  34.69 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0676  GatB/Yqey family protein  33.09 
 
 		 147 aa  84.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  36.91 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  40.54 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  34.9 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  34.9 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  36.91 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  36.05 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  39.19 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  34.9 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  40.94 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0601  GatB/Yqey family protein  33.09 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  35.33 
 
 		 513 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.51 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  35.33 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  35.86 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  32.17 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  31.72 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  35.37 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>