162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2333 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2333  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  291  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1180  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  38.13 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  34.75 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  32.86 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2093  GatB/Yqey domain protein  33.78 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  32.41 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  33.1 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  28.28 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3598  GatB/Yqey domain-containing protein  31.48 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  31.25 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  31.91 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  29.79 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  31.16 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  30.99 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  29.45 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  31.33 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  32.62 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  28.36 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  28.28 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  31.16 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1269  GatB/YqeY domain-containing protein  28.77 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000956  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  29.85 
 
 		 149 aa  57  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  31.97 
 
 		 513 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  32.39 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  26.51 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  28.37 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  30.56 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  29.29 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  27.14 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  32.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  27.59 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  30.99 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  30.99 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  30.82 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  29.45 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  31.08 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1088  GatB/YqeY domain-containing protein  27.97 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  28.67 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  28.47 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  29.79 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0139  conserved cytosolic protein  33.56 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136704  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  27.66 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  28.47 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  29.66 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  27.78 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  27.86 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  26.72 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  30 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  29.92 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  28.47 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  28.47 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  30.34 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1216  excinuclease ABC subunit A  28.87 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1367  GatB/Yqey domain-containing protein  29.86 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  27.86 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  32.14 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  25.69 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  31.11 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  25.36 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  38.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  27.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  29.08 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  31.94 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  31.08 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  31.54 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  26.43 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  23.57 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0497  GatB/YqeY family protein  30 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000186391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  26.71 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1336  GatB/Yqey domain-containing protein  31.03 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2848  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>