254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1242 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1242  GatB/Yqey domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3109  hypothetical protein  60 
 
 		 151 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  57.62 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  60.67 
 
 		 150 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2228  GatB/Yqey domain-containing protein  58.78 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  60 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  54.61 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  54 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  57.62 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  58.28 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  57.62 
 
 		 151 aa  167  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1684  GatB/Yqey domain-containing protein  64.43 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  53.69 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2445  hypothetical protein  58.28 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335329  normal  0.270323 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1438  hypothetical protein  61.07 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  53.02 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  53.02 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2315  GatB/Yqey domain-containing protein  59.33 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.271761  normal  0.0433719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1482  hypothetical protein  60.4 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3296  GatB/YqeY  56.29 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.644254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2082  hypothetical protein  53.38 
 
 		 149 aa  149  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3209  GatB/YqeY  55.26 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  52 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4527  GatB/YqeY  55.26 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  52.35 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  49.33 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0982  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2386  hypothetical protein  49.01 
 
 		 153 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0841233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1623  GatB/YqeY  52.98 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000911899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  47.37 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1875  hypothetical protein  51.68 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0525  GatB/Yqey domain-containing protein  51.68 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2232  hypothetical protein  51.01 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3033  hypothetical protein  46.48 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136858  normal  0.0601983 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0662  GatB/Yqey domain-containing protein  51.77 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14407  normal  0.0780089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2884  hypothetical protein  49.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  43.88 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2293  hypothetical protein  47.37 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  41.89 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.6 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  41.89 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40.27 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  38.51 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  35.48 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  42.45 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  39.6 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  38.93 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  38.26 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  40.67 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  36.42 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  42.75 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  38.51 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  35.14 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  38.51 
 
 		 148 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2059  hypothetical protein  37.93 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  35.46 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  37.86 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  41.55 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  39.19 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  35.76 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.84 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.16 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.16 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  35.33 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  35.14 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  38.85 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  44.29 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  37.84 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  37.84 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1418  GatB/YqeY domain protein  39.33 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  34.44 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  37.58 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  35.14 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  37.58 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  37.58 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  37.96 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  37.58 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  37.58 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>