251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1397 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1397  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 424 aa  841    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1921  UbiD family decarboxylase  80.38 
 
 		 425 aa  658    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0948  UbiD family decarboxylase  79.2 
 
 		 425 aa  664    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0856  UbiD family decarboxylase  83.92 
 
 		 424 aa  746    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0422  UbiD family decarboxylase  52.23 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.586666  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  49.21 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  37.94 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  39.81 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  38.32 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  37.85 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  38.55 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.44 
 
 		 421 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  38.43 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0122  UbiD family decarboxylase  41.62 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.695479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  37.21 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2139  UbiD family decarboxylase  47.57 
 
 		 413 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0510  UbiD family decarboxylase  40.1 
 
 		 412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0940  UbiD family decarboxylase  41.11 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  39.67 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2438  carboxylyase-like protein  41.31 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0767  UbiD family decarboxylase  38.24 
 
 		 411 aa  233  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  32.43 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  36.74 
 
 		 462 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  36.41 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  32.98 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  32.58 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  33.68 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  36.25 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  36.04 
 
 		 494 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  35.44 
 
 		 506 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  32.11 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  30.75 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  31.84 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  34.64 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  31.95 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  30.48 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  29.58 
 
 		 474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  30.4 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.42 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3679  Carboxylyase-related protein  30.53 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  27.64 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  30.7 
 
 		 527 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  29.36 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.2 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  28.76 
 
 		 480 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  26.94 
 
 		 502 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  28.53 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  28.4 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  30.38 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  29.97 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  27.07 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.75 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  29.31 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.38 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  29.31 
 
 		 502 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  29.14 
 
 		 504 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  29.36 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.44 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.25 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3877  UbiD family decarboxylase  28.76 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.358634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.83 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  29.39 
 
 		 520 aa  100  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.95 
 
 		 525 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.99 
 
 		 504 aa  96.3  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.99 
 
 		 504 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  27.95 
 
 		 508 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2388  UbiD family decarboxylase  28.29 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.0671796 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.33 
 
 		 525 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  28.04 
 
 		 495 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  28.7 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2119  UbiD family decarboxylase  31.87 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381426  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.39 
 
 		 522 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0467  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.56 
 
 		 497 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6296  UbiD family decarboxylase  28.18 
 
 		 502 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3989  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.27 
 
 		 475 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.33 
 
 		 506 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.32 
 
 		 501 aa  90.5  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  27.96 
 
 		 475 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  26.23 
 
 		 488 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.33 
 
 		 498 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.33 
 
 		 495 aa  90.1  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.19 
 
 		 482 aa  89.7  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  27.66 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  26.65 
 
 		 487 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  27.48 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  27.66 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  27.66 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  27.66 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  28.75 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1174  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.03 
 
 		 491 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  27.66 
 
 		 475 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  26.08 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.25 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  25.98 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  27.66 
 
 		 475 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  25.98 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  26.4 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  27.44 
 
 		 512 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  27.73 
 
 		 493 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  26.32 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>