279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3679 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3679  Carboxylyase-related protein  100 
 
 		 485 aa  953    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1174  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.61 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  35.88 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  33.83 
 
 		 469 aa  179  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  33.25 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  35.47 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  34.81 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  27.04 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  33 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  32.99 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  33.4 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  34.32 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  30.07 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  29.56 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  30.2 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  30.32 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  30.37 
 
 		 425 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  30.2 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  32.11 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  30.51 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  30.3 
 
 		 462 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.35 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  30.37 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  31.81 
 
 		 464 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  30.17 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  32.67 
 
 		 474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2438  carboxylyase-like protein  32.25 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  31.85 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  28.09 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  28.81 
 
 		 425 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0122  UbiD family decarboxylase  30 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.695479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.91 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  31.93 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.57 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.36 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2139  UbiD family decarboxylase  29.82 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  31.31 
 
 		 457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  32.66 
 
 		 509 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  25.59 
 
 		 514 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  26.81 
 
 		 502 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  27.27 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  30.36 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  28.76 
 
 		 443 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0510  UbiD family decarboxylase  30.92 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  27.38 
 
 		 504 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  27.32 
 
 		 502 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  26.89 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  26.89 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  31.55 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.3 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  30.26 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1061  UbiD family decarboxylase  30.91 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  28.98 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  27.86 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.22 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0940  UbiD family decarboxylase  30.24 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.54 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  28.32 
 
 		 497 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  28.28 
 
 		 493 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  28.45 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  28.64 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.58 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2520  UbiD family decarboxylase  29.32 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  27.95 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  28.31 
 
 		 512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0856  UbiD family decarboxylase  29.85 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.160491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.11 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  28.11 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.11 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.11 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  28.11 
 
 		 497 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0767  UbiD family decarboxylase  30.17 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  27.01 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.61 
 
 		 492 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1073  UbiD family decarboxylase  29.92 
 
 		 495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0961197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.37 
 
 		 525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.11 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.61 
 
 		 521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  31.96 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.86 
 
 		 497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  28.45 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  26.91 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.96 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.86 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.86 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.68 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.36 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  27.48 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  27.05 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  27.05 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.23 
 
 		 506 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  27.05 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.23 
 
 		 498 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.36 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  27.05 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.96 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.36 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.36 
 
 		 492 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  27.05 
 
 		 493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.96 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>