280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0716 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  100 
 
 		 421 aa  849    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  78.81 
 
 		 425 aa  699    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2139  UbiD family decarboxylase  53.46 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0940  UbiD family decarboxylase  55 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0510  UbiD family decarboxylase  53.49 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  53.49 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0122  UbiD family decarboxylase  50.12 
 
 		 413 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.695479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2438  carboxylyase-like protein  51.44 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  45.65 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  45.94 
 
 		 425 aa  333  4e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  45.65 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  45.41 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  43.96 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0767  UbiD family decarboxylase  43.04 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0422  UbiD family decarboxylase  42.4 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.586666  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0856  UbiD family decarboxylase  39.81 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  40.83 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0948  UbiD family decarboxylase  41.24 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1397  UbiD family decarboxylase  39.21 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  39.9 
 
 		 433 aa  249  9e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  38.57 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  35.02 
 
 		 443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  36.1 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  35.2 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1921  UbiD family decarboxylase  38.48 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  35.27 
 
 		 494 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  35.1 
 
 		 461 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  36.21 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  34.41 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  34.01 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  34.42 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  30.88 
 
 		 443 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  31.57 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  33.92 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.03 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.05 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.05 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  34.55 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.26 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  32.83 
 
 		 488 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  33.92 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  31.36 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.01 
 
 		 497 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.38 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  33.04 
 
 		 493 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.38 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.38 
 
 		 492 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.38 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  33.04 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  29.53 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  32.62 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  32.62 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  31.52 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.38 
 
 		 492 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  31.57 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.57 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  30.89 
 
 		 446 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  32.26 
 
 		 488 aa  186  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  31.57 
 
 		 497 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.57 
 
 		 497 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.57 
 
 		 497 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.57 
 
 		 497 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  32.4 
 
 		 493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  32.89 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.35 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  30.75 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  32.4 
 
 		 493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.02 
 
 		 488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  32.4 
 
 		 493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.39 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.35 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.46 
 
 		 498 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.24 
 
 		 498 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.31 
 
 		 506 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  31.76 
 
 		 496 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.24 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  32.62 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  31.93 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  31.86 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  32.09 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  31.36 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.91 
 
 		 501 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  31.5 
 
 		 498 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  31.19 
 
 		 488 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.28 
 
 		 498 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  31.64 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  31.86 
 
 		 488 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  31.58 
 
 		 487 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  29.66 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  32.82 
 
 		 493 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  30.19 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.67 
 
 		 491 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.8 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.25 
 
 		 489 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.37 
 
 		 617 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  33.12 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.22 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.77 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  31.37 
 
 		 617 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  31.73 
 
 		 493 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>