253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0856 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1921  UbiD family decarboxylase  79.72 
 
 		 425 aa  659    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0948  UbiD family decarboxylase  77.83 
 
 		 425 aa  664    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1397  UbiD family decarboxylase  83.92 
 
 		 424 aa  724    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0856  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 424 aa  847    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0422  UbiD family decarboxylase  49.87 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.586666  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  47.78 
 
 		 450 aa  323  4e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  41.08 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  38.12 
 
 		 425 aa  276  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  40.39 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  39.9 
 
 		 425 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  39.61 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.81 
 
 		 421 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  40.29 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0122  UbiD family decarboxylase  45.14 
 
 		 413 aa  263  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.695479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0510  UbiD family decarboxylase  41.6 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0940  UbiD family decarboxylase  40.99 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2139  UbiD family decarboxylase  47.25 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2438  carboxylyase-like protein  42.63 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  40.48 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0767  UbiD family decarboxylase  40.11 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  35.43 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  32.92 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  35.68 
 
 		 461 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  33.16 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  38.92 
 
 		 462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  37.05 
 
 		 494 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  36.75 
 
 		 494 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  37.05 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  39.01 
 
 		 469 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  34.98 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  32.2 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  30.25 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  31.98 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  32.59 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  31.94 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  33.43 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  30.75 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  31.31 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  31.65 
 
 		 527 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  28.65 
 
 		 457 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  29.44 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.13 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3679  Carboxylyase-related protein  29.85 
 
 		 485 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  27.17 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.77 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.4 
 
 		 521 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  29.6 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  27.95 
 
 		 480 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.86 
 
 		 502 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  27.17 
 
 		 504 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  30.58 
 
 		 502 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  28.64 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  30.34 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.19 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  30.34 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  28.84 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  29.77 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  29.94 
 
 		 481 aa  106  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  26.96 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.21 
 
 		 525 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.3 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.3 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  25.73 
 
 		 525 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.7 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.1 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  28.97 
 
 		 508 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2388  UbiD family decarboxylase  28.29 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.0671796 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3877  UbiD family decarboxylase  29.57 
 
 		 486 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.358634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 		 512 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1174  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.03 
 
 		 491 aa  95.9  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6296  UbiD family decarboxylase  27.46 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2520  UbiD family decarboxylase  26.26 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  27.67 
 
 		 504 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  28.79 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  26.76 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  28.48 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.48 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.47 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  28.48 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.21 
 
 		 502 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.48 
 
 		 475 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0766  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.55 
 
 		 597 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.48 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3989  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.79 
 
 		 475 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.48 
 
 		 475 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.16 
 
 		 618 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0467  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.54 
 
 		 497 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  27.76 
 
 		 488 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  27.76 
 
 		 550 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2119  UbiD family decarboxylase  27.29 
 
 		 497 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381426  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.12 
 
 		 488 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1757  UbiD family decarboxylase  27.07 
 
 		 477 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  26.25 
 
 		 495 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  25.32 
 
 		 488 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  27 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  27.8 
 
 		 488 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.1 
 
 		 498 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  25.78 
 
 		 491 aa  87.4  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  26.47 
 
 		 497 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>