281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3127 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  99.37 
 
 
475 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  97.05 
 
 
475 aa  952    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  99.37 
 
 
475 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  100 
 
 
475 aa  977    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  97.26 
 
 
475 aa  954    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  99.16 
 
 
475 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3989  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  97.26 
 
 
475 aa  955    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  99.37 
 
 
475 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  53.15 
 
 
476 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3877  UbiD family decarboxylase  45.68 
 
 
486 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.358634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.79 
 
 
502 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  30.49 
 
 
520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.7 
 
 
506 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  29.96 
 
 
502 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  30.35 
 
 
504 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  29.66 
 
 
502 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  29.66 
 
 
502 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.11 
 
 
522 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  30.72 
 
 
502 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.71 
 
 
521 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.88 
 
 
520 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.25 
 
 
490 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  29.23 
 
 
514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  28.72 
 
 
487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  29.89 
 
 
488 aa  183  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  29.16 
 
 
479 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.06 
 
 
525 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.5 
 
 
489 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0904  UbiD family decarboxylase  32.51 
 
 
480 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0122737  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  29.81 
 
 
495 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  28.92 
 
 
488 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.91 
 
 
525 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.83 
 
 
482 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.01 
 
 
492 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.01 
 
 
492 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.16 
 
 
488 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 
492 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.6 
 
 
501 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.39 
 
 
491 aa  176  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 
492 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.94 
 
 
488 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.94 
 
 
550 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.02 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.73 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  27.97 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.45 
 
 
498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.45 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  27.65 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.45 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.98 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  28.95 
 
 
496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  28.82 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  27.98 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  28.94 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  28.73 
 
 
492 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  28.11 
 
 
493 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.91 
 
 
498 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
520 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  29.02 
 
 
493 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  28.45 
 
 
488 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.62 
 
 
497 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  27.45 
 
 
498 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  28.6 
 
 
493 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 
493 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.71 
 
 
498 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  29.44 
 
 
493 aa  172  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  27.9 
 
 
493 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.62 
 
 
497 aa  172  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  27.82 
 
 
487 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  27.51 
 
 
498 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.84 
 
 
487 aa  170  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  29.03 
 
 
488 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.63 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.08 
 
 
509 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.28 
 
 
504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.24 
 
 
506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  28.18 
 
 
487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.07 
 
 
504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.86 
 
 
536 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  28.45 
 
 
488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  27.35 
 
 
488 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0467  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.25 
 
 
497 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  28.6 
 
 
493 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2119  UbiD family decarboxylase  28.46 
 
 
497 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381426  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.18 
 
 
497 aa  163  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.97 
 
 
502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  27.95 
 
 
481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>