279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3877 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009426  Saro_3877  UbiD family decarboxylase  100 
 
 
486 aa  992    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.358634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  47.47 
 
 
476 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  45.9 
 
 
475 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3989  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  45.9 
 
 
475 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  45.68 
 
 
475 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  45.9 
 
 
475 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  45.9 
 
 
475 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  45.9 
 
 
475 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  45.68 
 
 
475 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  45.9 
 
 
475 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  33.91 
 
 
461 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  33.33 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.91 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  33.48 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.19 
 
 
522 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.67 
 
 
521 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.15 
 
 
525 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  28.94 
 
 
502 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.82 
 
 
421 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.78 
 
 
502 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.79 
 
 
491 aa  159  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  30.41 
 
 
425 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.94 
 
 
525 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.17 
 
 
520 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.68 
 
 
497 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  29.96 
 
 
520 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  28.39 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  28.39 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2926  UbiD family decarboxylase  29.19 
 
 
483 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.21 
 
 
506 aa  156  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.56 
 
 
492 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.56 
 
 
492 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.56 
 
 
492 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.56 
 
 
492 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  29.25 
 
 
495 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.68 
 
 
497 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  28.69 
 
 
504 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.47 
 
 
497 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  29.47 
 
 
497 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.56 
 
 
492 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.47 
 
 
497 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  29.47 
 
 
497 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.47 
 
 
497 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.64 
 
 
501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.26 
 
 
497 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  27.99 
 
 
502 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.26 
 
 
497 aa  154  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.72 
 
 
498 aa  153  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.23 
 
 
498 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.72 
 
 
506 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  28.02 
 
 
488 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  28.23 
 
 
488 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.72 
 
 
495 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  30.11 
 
 
488 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  28.95 
 
 
487 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.35 
 
 
509 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  33.73 
 
 
494 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.43 
 
 
502 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  32.61 
 
 
469 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.08 
 
 
506 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  32.3 
 
 
487 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.26 
 
 
488 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.28 
 
 
488 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.06 
 
 
550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.33 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.67 
 
 
498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  27.59 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  28.28 
 
 
488 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
488 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  31.28 
 
 
508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  28.97 
 
 
488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.6 
 
 
488 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  28.11 
 
 
487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  28.63 
 
 
488 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  28.66 
 
 
488 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  27.02 
 
 
491 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  30.52 
 
 
494 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  28.08 
 
 
488 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.99 
 
 
489 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  27.9 
 
 
492 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  28.9 
 
 
512 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  35.56 
 
 
506 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  31.69 
 
 
527 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  28.08 
 
 
498 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  28.91 
 
 
488 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  28.73 
 
 
493 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  26.92 
 
 
443 aa  144  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.73 
 
 
493 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.73 
 
 
493 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.73 
 
 
493 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  32.75 
 
 
472 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  28.08 
 
 
493 aa  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.16 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  28.04 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.39 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  27.86 
 
 
498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  29.21 
 
 
476 aa  141  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  28.66 
 
 
493 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  30.12 
 
 
496 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  28.04 
 
 
481 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>