281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3039 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  97.89 
 
 
475 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  98.74 
 
 
475 aa  966    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  97.68 
 
 
475 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  97.89 
 
 
475 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  97.26 
 
 
475 aa  954    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  100 
 
 
475 aa  976    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3989  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  99.16 
 
 
475 aa  971    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  97.89 
 
 
475 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  53.26 
 
 
476 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3877  UbiD family decarboxylase  45.68 
 
 
486 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.358634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.4 
 
 
502 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  30.77 
 
 
520 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.11 
 
 
506 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  31.14 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  30.96 
 
 
504 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  30.17 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.36 
 
 
520 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.11 
 
 
522 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  29.66 
 
 
502 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  29.66 
 
 
502 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30 
 
 
521 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  28.51 
 
 
487 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.6 
 
 
489 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  29.01 
 
 
514 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.03 
 
 
490 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  29.37 
 
 
479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.54 
 
 
525 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  29.25 
 
 
488 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.01 
 
 
493 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.06 
 
 
525 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  30.45 
 
 
495 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.01 
 
 
493 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  28.37 
 
 
488 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.01 
 
 
493 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.66 
 
 
492 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.66 
 
 
492 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.57 
 
 
482 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0904  UbiD family decarboxylase  32.14 
 
 
480 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0122737  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  28.6 
 
 
488 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.66 
 
 
492 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.46 
 
 
492 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  28.96 
 
 
493 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.62 
 
 
488 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  28.25 
 
 
493 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.46 
 
 
492 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  27.77 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
498 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  28.96 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.33 
 
 
506 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.39 
 
 
491 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  29.58 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.35 
 
 
550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  27.42 
 
 
492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.35 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.45 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  28.05 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.02 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.23 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.45 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  27.77 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  28.12 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  27.82 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.82 
 
 
498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  28.39 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.42 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  27.06 
 
 
491 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  28.39 
 
 
488 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  28.54 
 
 
496 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.62 
 
 
497 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.62 
 
 
497 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  27.35 
 
 
498 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.42 
 
 
520 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.33 
 
 
487 aa  170  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  28.82 
 
 
488 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.85 
 
 
490 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  28.07 
 
 
487 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  26.78 
 
 
487 aa  167  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  27.35 
 
 
488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.29 
 
 
509 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  26.98 
 
 
497 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.24 
 
 
506 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  27.71 
 
 
487 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  28.12 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.66 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  27.14 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  30.42 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  28.57 
 
 
503 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  27.47 
 
 
503 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  28.35 
 
 
488 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.49 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>