280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7140 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  75.28 
 
 		 461 aa  725    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  84.48 
 
 		 464 aa  801    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  83.95 
 
 		 464 aa  803    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 464 aa  951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  66.45 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  60.49 
 
 		 457 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  36.36 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  37.84 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  34.83 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  34.76 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  34.97 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  32.49 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  34.06 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  32.77 
 
 		 443 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  34.6 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  34.88 
 
 		 469 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  29.76 
 
 		 443 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  34.45 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  31.91 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  32.4 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.65 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  32.81 
 
 		 527 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  29.58 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  34.65 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  29.81 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.2 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.26 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  29.89 
 
 		 479 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  28.19 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.1 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.21 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.21 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.46 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  29.23 
 
 		 502 aa  166  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  28.47 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.05 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  28.72 
 
 		 492 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.98 
 
 		 520 aa  163  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  29.15 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  31.32 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  28.71 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  30.27 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  31.32 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  28.94 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.51 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.25 
 
 		 525 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  28.41 
 
 		 493 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  29.32 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  29.13 
 
 		 488 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.49 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.49 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  29.93 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.79 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  31.88 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  28.91 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  28.21 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  29.68 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.02 
 
 		 525 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  29.26 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  27.08 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  28.91 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  29.36 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  28.91 
 
 		 550 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2520  UbiD family decarboxylase  27.05 
 
 		 469 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  27.32 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.13 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  36.19 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  26.96 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.69 
 
 		 489 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  30.04 
 
 		 617 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  28.28 
 
 		 504 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  29.11 
 
 		 606 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  30.86 
 
 		 425 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  27.59 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  29.48 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0132  carboxylyase-like protein  27.97 
 
 		 494 aa  153  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.44 
 
 		 506 aa  153  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  29.52 
 
 		 488 aa  153  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  31.96 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.8 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  30.86 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  27.08 
 
 		 493 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.12 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.67 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.98 
 
 		 498 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  27.08 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  27.08 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  27.08 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.25 
 
 		 498 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.25 
 
 		 506 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  29.52 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.02 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  31.07 
 
 		 425 aa  150  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.91 
 
 		 492 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1236  UbiD family decarboxylase  29.86 
 
 		 478 aa  149  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0407315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.91 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.49 
 
 		 493 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  27.11 
 
 		 617 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>