280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0404 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0404  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 450 aa  907    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0856  UbiD family decarboxylase  47.78 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1397  UbiD family decarboxylase  49.21 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0948  UbiD family decarboxylase  49.08 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1921  UbiD family decarboxylase  50 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0422  UbiD family decarboxylase  43.32 
 
 		 440 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.586666  normal  0.969169 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1473  carboxylyase-like protein  41.28 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0383556  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0716  4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.71 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1597  UbiD family decarboxylase  35.27 
 
 		 443 aa  276  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0014  UbiD family decarboxylase  40.36 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1386  UbiD family decarboxylase  37.91 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0617  UbiD family decarboxylase  40.58 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0305  UbiD family decarboxylase  37.67 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0533  UbiD family decarboxylase  37.75 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0940  UbiD family decarboxylase  39.86 
 
 		 417 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0598  UbiD family decarboxylase  38.77 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0510  UbiD family decarboxylase  45.57 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0767  UbiD family decarboxylase  42.86 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0122  UbiD family decarboxylase  42.55 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.695479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3716  UbiD family decarboxylase  36.38 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2139  UbiD family decarboxylase  45.29 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2187  UbiD family decarboxylase  36.22 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6675  UbiD family decarboxylase  36.44 
 
 		 506 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2071  carboxylyase-like protein  35.33 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4788  UbiD family decarboxylase  37.19 
 
 		 462 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.565671  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0057  hypothetical protein  36.63 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00482373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1310  UbiD family decarboxylase  37.1 
 
 		 469 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0843  carboxylyase-like protein  34.72 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4732  UbiD family decarboxylase  36.94 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2438  carboxylyase-like protein  43.48 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.396144 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4699  UbiD family decarboxylase  35.41 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4939  UbiD family decarboxylase  35.52 
 
 		 443 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3071  carboxylyase-like protein  35.05 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0542866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3999  UbiD family decarboxylase  35.15 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3430  carboxylyase-like protein  33.66 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540081  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7140  UbiD family decarboxylase  36.19 
 
 		 464 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493954  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3609  UbiD family decarboxylase  33.88 
 
 		 464 aa  183  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0078  UbiD family decarboxylase  30.99 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1167  carboxylyase-like protein  32.58 
 
 		 447 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.879428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0636  carboxylyase-like protein  33.6 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1121  carboxylyase-like protein  29.58 
 
 		 462 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1108  carboxylyase-like protein  30 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1419  carboxylyase-like protein  35.29 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2926  UbiD family decarboxylase  30.68 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7527  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  33.03 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  28.67 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2353  carboxylyase-like protein  33.51 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2535  carboxylyase-like protein  32.4 
 
 		 527 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.179898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3994  UbiD family decarboxylase  30.3 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247967  normal  0.0822542 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3877  UbiD family decarboxylase  31.62 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.358634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3679  Carboxylyase-related protein  30.85 
 
 		 485 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0381  carboxylyase-like protein  28.72 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  28.31 
 
 		 514 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  24.78 
 
 		 502 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  24.78 
 
 		 502 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  29.88 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.72 
 
 		 509 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1174  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.77 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2520  UbiD family decarboxylase  28.19 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.29 
 
 		 521 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  28.96 
 
 		 502 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.81 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  30.63 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.28 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  24.57 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.8 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.07 
 
 		 484 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.99 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2119  UbiD family decarboxylase  28.29 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381426  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.7 
 
 		 498 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  29.45 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0467  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.07 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.82 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  29.02 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  30.14 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  30.14 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  31.42 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  30.72 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.82 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.82 
 
 		 498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  25.85 
 
 		 525 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  31.12 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  31.12 
 
 		 475 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  31.12 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  31.12 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.91 
 
 		 520 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  24.95 
 
 		 504 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  29.82 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  29.82 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  28.44 
 
 		 488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  29.94 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  30.91 
 
 		 475 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  30.36 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.54 
 
 		 490 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  30.91 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  29.03 
 
 		 512 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  29.28 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  27.59 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2388  UbiD family decarboxylase  27.85 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.0671796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  29.45 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>