280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1061 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1061  UbiD family decarboxylase  100 
 
 
490 aa  984    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3657  UbiD family decarboxylase  42.19 
 
 
497 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.072913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1073  UbiD family decarboxylase  42.57 
 
 
495 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0961197  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03130  hypothetical protein  41.94 
 
 
496 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456307  hitchhiker  0.000000178066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0338  hypothetical protein  41.12 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00230  cytoplasm protein, putative  32.64 
 
 
404 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.923309  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4166  Carboxylyase-related protein  33.48 
 
 
498 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2926  UbiD family decarboxylase  30.16 
 
 
483 aa  203  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0904  UbiD family decarboxylase  34.36 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0122737  normal  0.0906126 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07164  conserved hypothetical protein  33.61 
 
 
534 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.750517  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2127  Carboxylyase-related protein  35.62 
 
 
532 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2102  carboxylyase-like protein  27.53 
 
 
514 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.43 
 
 
522 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  29.17 
 
 
487 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  29.66 
 
 
498 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  28.51 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.92 
 
 
495 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.92 
 
 
498 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.92 
 
 
506 aa  154  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
497 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.28 
 
 
497 aa  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.68 
 
 
488 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.74 
 
 
501 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  29.68 
 
 
498 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.28 
 
 
506 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  27.36 
 
 
488 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  29.22 
 
 
488 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.05 
 
 
498 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.59 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.66 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.28 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.28 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.51 
 
 
492 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.28 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  28.8 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.08 
 
 
488 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  28.8 
 
 
488 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  27.13 
 
 
488 aa  146  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.83 
 
 
488 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.5 
 
 
493 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.13 
 
 
493 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.13 
 
 
493 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  30.28 
 
 
498 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2863  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.27 
 
 
475 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3989  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.48 
 
 
475 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  27.83 
 
 
488 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  27.82 
 
 
493 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  27.83 
 
 
550 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  26.44 
 
 
493 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  26.67 
 
 
493 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  27.73 
 
 
492 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.52 
 
 
490 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3039  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.27 
 
 
475 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  26.9 
 
 
493 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  29.78 
 
 
493 aa  144  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  26.44 
 
 
493 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  27.02 
 
 
488 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  26.44 
 
 
493 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  25.98 
 
 
493 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  28.74 
 
 
488 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  27.6 
 
 
488 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  26.44 
 
 
493 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  26.44 
 
 
493 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  30.4 
 
 
485 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  27.83 
 
 
488 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3127  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  28.48 
 
 
475 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.147886 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  27.02 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3231  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.27 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3111  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  28.27 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3072  4-hydroxybenzoate decarboxylase subunit C  28.27 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901205 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3043  4-hydroxybenzoate decarboxylase, subunit C  28.27 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  26.67 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  26.54 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.56 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  28.7 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  30.61 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  26.96 
 
 
493 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  28.57 
 
 
487 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.15 
 
 
488 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  27.9 
 
 
481 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  27.92 
 
 
495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.5 
 
 
504 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  28.02 
 
 
496 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  30.91 
 
 
617 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  25.23 
 
 
493 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  26.85 
 
 
492 aa  136  9e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.35 
 
 
507 aa  136  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  28.8 
 
 
487 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  26.07 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.05 
 
 
504 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.45 
 
 
490 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  31.79 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  28.64 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>