More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1567 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1567  ABC transporter related  100 
 
 
653 aa  1273    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.989153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0999  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component-like protein  49.76 
 
 
591 aa  489  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0982  hypothetical protein  32.64 
 
 
588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5572  ABC transporter related protein  33.12 
 
 
593 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4200  ABC transporter related  31.34 
 
 
591 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117631  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0068  ABC transporter related  31.32 
 
 
593 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.76 
 
 
580 aa  147  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 
603 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  24.75 
 
 
548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  28.9 
 
 
566 aa  134  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.35 
 
 
598 aa  133  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  27.75 
 
 
573 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.49 
 
 
598 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  27.46 
 
 
578 aa  130  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3747  ABC transporter related  25.94 
 
 
565 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.903721  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1898  ABC transporter related  26.25 
 
 
742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  33.45 
 
 
623 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.17 
 
 
600 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  34.44 
 
 
643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.99 
 
 
608 aa  128  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.39 
 
 
971 aa  128  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  27.54 
 
 
596 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  29.34 
 
 
631 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  38.55 
 
 
733 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  27.56 
 
 
573 aa  127  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.57 
 
 
634 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  37.97 
 
 
613 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  29.13 
 
 
577 aa  127  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.57 
 
 
634 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  25.99 
 
 
762 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  25.24 
 
 
598 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 
577 aa  127  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  24.53 
 
 
583 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.23 
 
 
586 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  29.04 
 
 
589 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  24.96 
 
 
611 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.57 
 
 
644 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.57 
 
 
644 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.32 
 
 
586 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  30 
 
 
589 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  23.57 
 
 
547 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  23.29 
 
 
583 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  25.47 
 
 
603 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  32.21 
 
 
589 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.32 
 
 
586 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.14 
 
 
574 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.14 
 
 
574 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  35.09 
 
 
611 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  26.17 
 
 
630 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  26.09 
 
 
586 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.41 
 
 
625 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  29.53 
 
 
579 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
590 aa  124  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0563  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  31.94 
 
 
574 aa  124  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0681013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.87 
 
 
613 aa  124  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  28.61 
 
 
582 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0935  ABC transporter related protein  31.03 
 
 
679 aa  123  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.06 
 
 
721 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  25.07 
 
 
576 aa  124  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  27.5 
 
 
589 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  33.56 
 
 
637 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  34.03 
 
 
612 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  23.56 
 
 
568 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.35 
 
 
1000 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  39.01 
 
 
608 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  28.37 
 
 
616 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  28.45 
 
 
586 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  27.68 
 
 
610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  29.7 
 
 
578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  24.09 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  27.68 
 
 
610 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4843  ABC transporter related  25.19 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929922  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  33.56 
 
 
637 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  26.43 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  27.31 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  32.88 
 
 
663 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  36.88 
 
 
724 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  25.8 
 
 
577 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  29.66 
 
 
760 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  36.88 
 
 
724 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  32.65 
 
 
636 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 
529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.28 
 
 
573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  35.25 
 
 
550 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0690  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  26.92 
 
 
581 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.212037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  25.76 
 
 
726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  25.04 
 
 
595 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
619 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.86 
 
 
597 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.34 
 
 
597 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21990  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.74 
 
 
620 aa  120  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.19 
 
 
596 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  31.92 
 
 
572 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1843  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  32.64 
 
 
605 aa  120  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00685655  hitchhiker  0.00648796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  26.64 
 
 
621 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  27.3 
 
 
715 aa  120  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.34 
 
 
606 aa  120  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  22.75 
 
 
586 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  25.77 
 
 
598 aa  120  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>