More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5572 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0068  ABC transporter related  65.64 
 
 		 593 aa  822    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5572  ABC transporter related protein  100 
 
 		 593 aa  1215    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4200  ABC transporter related  60.71 
 
 		 591 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0982  hypothetical protein  36.72 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1567  ABC transporter related  32.49 
 
 		 653 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.989153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0999  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component-like protein  32.47 
 
 		 591 aa  298  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  26.45 
 
 		 625 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  26.64 
 
 		 591 aa  163  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  25.45 
 
 		 587 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.12 
 
 		 986 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.37 
 
 		 738 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  26.28 
 
 		 583 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 893 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 597 aa  160  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.18 
 
 		 577 aa  160  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.38 
 
 		 736 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  24.8 
 
 		 618 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  36.32 
 
 		 630 aa  156  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  24.79 
 
 		 586 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.23 
 
 		 715 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  25.38 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.62 
 
 		 727 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  27.52 
 
 		 589 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  25.29 
 
 		 598 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4394  response regulator receiver protein  27 
 
 		 906 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0230097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  24.79 
 
 		 624 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.76 
 
 		 596 aa  154  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  25.2 
 
 		 585 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 981 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1440  ABC transporter related  26.16 
 
 		 770 aa  153  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338764  normal  0.147226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  26.8 
 
 		 569 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 991 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  29.32 
 
 		 455 aa  153  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1935  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.83 
 
 		 606 aa  153  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  24.91 
 
 		 583 aa  153  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  35.17 
 
 		 643 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  25 
 
 		 581 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  25.68 
 
 		 592 aa  153  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.64 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  28.54 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  27.1 
 
 		 595 aa  151  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  26.49 
 
 		 590 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  34.16 
 
 		 596 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  26.98 
 
 		 663 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  26.98 
 
 		 636 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.05 
 
 		 621 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1984  ABC transporter related  26.92 
 
 		 605 aa  150  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25.89 
 
 		 722 aa  150  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.18 
 
 		 637 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 602 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.18 
 
 		 637 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.92 
 
 		 606 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4560  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  26.18 
 
 		 594 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  25.21 
 
 		 586 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  24.92 
 
 		 599 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  26.29 
 
 		 599 aa  150  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  25.82 
 
 		 727 aa  150  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  34.33 
 
 		 623 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  26.19 
 
 		 726 aa  150  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  34.16 
 
 		 593 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  32.18 
 
 		 611 aa  150  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  31.35 
 
 		 988 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1994  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 965 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.310969  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  30.46 
 
 		 936 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  25.55 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 988 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  25.67 
 
 		 583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  31.35 
 
 		 988 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  24.92 
 
 		 612 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  28.28 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  27.45 
 
 		 719 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  31.35 
 
 		 988 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  24.84 
 
 		 610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  32.21 
 
 		 625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.44 
 
 		 734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 988 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.32 
 
 		 591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.32 
 
 		 609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  24.5 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 914 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  29.38 
 
 		 617 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  25.46 
 
 		 607 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  24.92 
 
 		 612 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 988 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  27.36 
 
 		 716 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  27.22 
 
 		 619 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  25.28 
 
 		 604 aa  148  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5296  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  26.54 
 
 		 590 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.859182  normal  0.362454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.05 
 
 		 741 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4829  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  26.61 
 
 		 590 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.311889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  28.28 
 
 		 587 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02570  ABC transporter, putative  25.45 
 
 		 1216 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  25.21 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  36.75 
 
 		 637 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 921 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.62 
 
 		 621 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.62 
 
 		 621 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  31.54 
 
 		 581 aa  147  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.62 
 
 		 621 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>