More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4200 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4200  ABC transporter related  100 
 
 		 591 aa  1221    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5572  ABC transporter related protein  60.71 
 
 		 593 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0068  ABC transporter related  65.65 
 
 		 593 aa  816    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0982  hypothetical protein  36.08 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1567  ABC transporter related  31.88 
 
 		 653 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.989153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0999  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component-like protein  31.09 
 
 		 591 aa  299  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  26.41 
 
 		 625 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  25.04 
 
 		 591 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  25.6 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  27.72 
 
 		 599 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  24.17 
 
 		 591 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 981 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  26.63 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  25.71 
 
 		 991 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  26.64 
 
 		 595 aa  169  9e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  27.17 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  25.04 
 
 		 652 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  26.39 
 
 		 604 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  25.08 
 
 		 582 aa  167  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  31.9 
 
 		 588 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  31.9 
 
 		 588 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  26.01 
 
 		 587 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  24.59 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  24.79 
 
 		 595 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3695  ABC transporter related  28.57 
 
 		 603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  26.64 
 
 		 588 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  24.23 
 
 		 583 aa  163  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  27.59 
 
 		 572 aa  163  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.39 
 
 		 632 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  26.53 
 
 		 604 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  25.91 
 
 		 600 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.06 
 
 		 727 aa  161  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  30.91 
 
 		 611 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  26.32 
 
 		 566 aa  160  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  24.21 
 
 		 598 aa  160  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.91 
 
 		 628 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  24.71 
 
 		 602 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  25.9 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  28.11 
 
 		 591 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.52 
 
 		 573 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  27.58 
 
 		 739 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  26.04 
 
 		 601 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.04 
 
 		 741 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  31.34 
 
 		 630 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  24.88 
 
 		 606 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  26.1 
 
 		 598 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  24.63 
 
 		 603 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.95 
 
 		 634 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.65 
 
 		 582 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  26.97 
 
 		 606 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  22.92 
 
 		 604 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  31.75 
 
 		 633 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  24.51 
 
 		 618 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.86 
 
 		 625 aa  157  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  30.64 
 
 		 589 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.63 
 
 		 580 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.95 
 
 		 641 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  26.95 
 
 		 611 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  23.67 
 
 		 620 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  23.67 
 
 		 620 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  24.86 
 
 		 594 aa  157  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  23.67 
 
 		 620 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  24.66 
 
 		 585 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  26.81 
 
 		 598 aa  157  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  24.71 
 
 		 612 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  25.04 
 
 		 601 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  24.71 
 
 		 612 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  24.15 
 
 		 596 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 595 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  31.8 
 
 		 612 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.58 
 
 		 738 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  24.91 
 
 		 596 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  25.82 
 
 		 628 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1812  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  27.17 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.960805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  27.5 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  25.57 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4242  ABC transporter related  26.16 
 
 		 644 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.235556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  24.24 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  25.48 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35 
 
 		 639 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.02 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  24.8 
 
 		 595 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4346  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  25.3 
 
 		 591 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.298679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  30.95 
 
 		 609 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  25.68 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.9 
 
 		 637 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  26.63 
 
 		 613 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.32 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  24.09 
 
 		 622 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1763  transport ATP-binding protein  25.25 
 
 		 574 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.162494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  25.29 
 
 		 625 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  24.7 
 
 		 607 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 602 aa  154  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.25 
 
 		 605 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  24.14 
 
 		 611 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0674  hypothetical protein  24.31 
 
 		 581 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  25.15 
 
 		 602 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2024  transport ATP-binding protein CydD  25.64 
 
 		 574 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.605538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  26.04 
 
 		 737 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.07 
 
 		 621 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>