More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4242 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0946  ABC transporter related  59.9 
 
 		 639 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.039967  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4242  ABC transporter related  100 
 
 		 644 aa  1300    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.235556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  34.5 
 
 		 613 aa  293  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.05 
 
 		 619 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  32.89 
 
 		 593 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  33.06 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  36.58 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  32.73 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  34.05 
 
 		 619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0242  ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 706 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  35.03 
 
 		 617 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.28 
 
 		 617 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  35 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  34.83 
 
 		 617 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  34.83 
 
 		 617 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  32.28 
 
 		 607 aa  273  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  36.24 
 
 		 617 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3695  ABC transporter related  35.91 
 
 		 603 aa  273  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  35.03 
 
 		 617 aa  273  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.69 
 
 		 595 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07111  hypothetical protein  33.79 
 
 		 612 aa  270  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  33.47 
 
 		 610 aa  269  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 658 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  34.39 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 616 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  32.77 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  34.71 
 
 		 609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  34.71 
 
 		 609 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  34.19 
 
 		 609 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2721  ABC transporter related  35.42 
 
 		 615 aa  267  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  33.47 
 
 		 610 aa  266  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  32.54 
 
 		 638 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  38.54 
 
 		 624 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  33.47 
 
 		 603 aa  265  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  33.55 
 
 		 617 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  37.43 
 
 		 621 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  33.27 
 
 		 603 aa  263  6e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 609 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  33.27 
 
 		 598 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001285  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  32.65 
 
 		 603 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000363731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  34.91 
 
 		 618 aa  262  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1666  ABC transporter related  35.21 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.66549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  31.53 
 
 		 609 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  32.94 
 
 		 609 aa  260  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1588  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.04 
 
 		 612 aa  259  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00688  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  32.48 
 
 		 613 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0450616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2579  putative hemolysin secretion ATP-binding protein  38.41 
 
 		 611 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000689381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  34.34 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 598 aa  258  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  30.91 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  32.74 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  33.09 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  32.51 
 
 		 626 aa  257  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  33.58 
 
 		 609 aa  257  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  35.13 
 
 		 622 aa  256  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 		 609 aa  256  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.99 
 
 		 612 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  32.01 
 
 		 597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  34.32 
 
 		 619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.12 
 
 		 619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  36.76 
 
 		 621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  36.4 
 
 		 614 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.73 
 
 		 596 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  31.29 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2941  ABC transporter related  33.09 
 
 		 609 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.417973  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2801  ABC transporter related  33.09 
 
 		 609 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0386861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  33 
 
 		 622 aa  253  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.92 
 
 		 632 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.53 
 
 		 634 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6066  ABC transporter related  34.44 
 
 		 617 aa  253  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0549196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.98 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2135  ABC transporter-related protein  34.84 
 
 		 630 aa  253  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  33.09 
 
 		 609 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1214  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 		 609 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.26 
 
 		 594 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  35.59 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2089  ABC transporter related  35.21 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.240835  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  30.92 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  31.17 
 
 		 609 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1740  ABC transporter related  33.99 
 
 		 609 aa  251  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0539083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3611  ABC transporter related  35.54 
 
 		 626 aa  250  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2848  ABC transporter-related protein  35 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.934041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  31.84 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.39 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  31.36 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 619 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  32.01 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04842  ABC transporter ATP-binding protein  31.64 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  37.87 
 
 		 621 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  32.97 
 
 		 618 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3491  ATPase  35.81 
 
 		 614 aa  248  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.06 
 
 		 641 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  34.18 
 
 		 616 aa  247  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.47 
 
 		 575 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  34.87 
 
 		 618 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4542  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.82 
 
 		 610 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0108  ABC transporter related  30.9 
 
 		 636 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.366198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  31.53 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  34.3 
 
 		 617 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>