More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0410 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0410  transcriptional regulator IclR-like protein  100 
 
 		 127 aa  261  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 246 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  55.12 
 
 		 246 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  49.61 
 
 		 254 aa  133  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  42.74 
 
 		 252 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 268 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 262 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  38.58 
 
 		 256 aa  103  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 272 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 261 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 254 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  41.6 
 
 		 252 aa  100  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 252 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  39.37 
 
 		 255 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 267 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  40.48 
 
 		 256 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  38.1 
 
 		 264 aa  94.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  31.5 
 
 		 262 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  38.71 
 
 		 260 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 257 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 261 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 		 259 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 		 251 aa  90.1  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 277 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  37.98 
 
 		 257 aa  89.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  32.54 
 
 		 260 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 260 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  41.74 
 
 		 263 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 277 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 248 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 271 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 260 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 260 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 265 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 260 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  39.13 
 
 		 263 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  34.45 
 
 		 278 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  40 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  32.54 
 
 		 255 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  40 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 284 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  40 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 260 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 263 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  40 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  40 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 260 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 		 246 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  33.07 
 
 		 265 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  38.52 
 
 		 263 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.65 
 
 		 258 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 		 280 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  34.86 
 
 		 255 aa  83.6  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 290 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  33.86 
 
 		 294 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  32.79 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.97 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  39.66 
 
 		 277 aa  80.5  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 269 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  35.4 
 
 		 265 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 299 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  36.52 
 
 		 263 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 281 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 249 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 249 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.81 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  35.65 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  36.75 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  36.52 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 262 aa  77.8  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 267 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 262 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.52 
 
 		 246 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 266 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 257 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>