More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1292 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1292  branched chain amino acid ABC transporter permease  100 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  38.49 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2266  inner-membrane translocator  33.85 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0901269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  35.88 
 
 		 593 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.47 
 
 		 593 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.67 
 
 		 646 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  29 
 
 		 646 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2429  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease  30.22 
 
 		 628 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 632 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4480  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0625  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  32.67 
 
 		 606 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  29.83 
 
 		 582 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1213  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0733  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4795  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4648  inner-membrane translocator  33.81 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  25.5 
 
 		 646 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4123  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0543  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 352 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  32.75 
 
 		 832 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 633 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.12 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7595  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.45 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  29.68 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 642 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  28.22 
 
 		 647 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  31.93 
 
 		 643 aa  95.9  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  29.08 
 
 		 418 aa  95.5  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  31.12 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  27.74 
 
 		 418 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  25.94 
 
 		 646 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  31.12 
 
 		 648 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 346 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 637 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  32.65 
 
 		 823 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.88 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2363  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0322104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.38 
 
 		 328 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  30.48 
 
 		 830 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0678  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  29.55 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  32 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.3 
 
 		 823 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 571 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2284  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.98813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1004  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4183  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 358 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  32.03 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  26.03 
 
 		 643 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2919  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0112  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.97 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  26.03 
 
 		 421 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0838  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.825897  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  31.86 
 
 		 608 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2789  inner-membrane translocator  29.18 
 
 		 350 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0355549 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 562 aa  90.1  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0563  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.71 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000316396  normal  0.689961 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  28.62 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  29.59 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4071  inner-membrane translocator  28.15 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0772  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.136837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  28.62 
 
 		 663 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 407 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>