More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7595 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7595  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6453  inner-membrane translocator  45.49 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  hitchhiker  0.00000000384407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.6 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0115  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  33.53 
 
 		 663 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 562 aa  112  8.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0477  inner-membrane translocator  30.16 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.210882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0999  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.32 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.203493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 281 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  33.11 
 
 		 593 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0801  inner-membrane translocator  33.57 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.950338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 633 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  32.12 
 
 		 593 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3659  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6116  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.18 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  30.12 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  31.09 
 
 		 593 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2358  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165636  normal  0.556674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2283  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.13 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  33.57 
 
 		 611 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.8 
 
 		 646 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0312  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.950676  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0006  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2587  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629922  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  28.42 
 
 		 415 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 632 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 642 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 360 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  32.33 
 
 		 608 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 401 aa  97.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  28.38 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  29.82 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1821  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2266  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0901269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0261  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2501  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0403  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3966  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 337 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  29.53 
 
 		 646 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4425  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  30.32 
 
 		 606 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  27.49 
 
 		 407 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 407 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  26.43 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1708  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550604  normal  0.0112984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  28.25 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  31.88 
 
 		 832 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  26.4 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  30.29 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  27 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  29.43 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1213  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4064  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0045  inner-membrane translocator  30 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  28.72 
 
 		 648 aa  93.2  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2311  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.90856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1662  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 637 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.94 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1090  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 359 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.538994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1582  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4906  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3270  ABC transporter related  31.52 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0221  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.66 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3829  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>