More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1213 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1213  inner-membrane translocator  100 
 
 		 294 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0733  inner-membrane translocator  66.2 
 
 		 313 aa  326  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4911  inner-membrane translocator  54.55 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2494  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.17 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.272138  hitchhiker  0.00284641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  37.37 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 327 aa  148  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  36.94 
 
 		 401 aa  145  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  36.59 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 281 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  37 
 
 		 372 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2266  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0901269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 318 aa  138  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  36.02 
 
 		 362 aa  132  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 372 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  37.08 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3838  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242692  normal  0.204744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 317 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.26 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  33.81 
 
 		 423 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2040  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000437253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  30.11 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  33.33 
 
 		 389 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 358 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 398 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  33.6 
 
 		 321 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 359 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 562 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 358 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.68 
 
 		 830 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2187  inner-membrane translocator  30.83 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  34.87 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 389 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.25 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0474  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 336 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  32.02 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  33.08 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1407  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.86 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.45 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  35.04 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0835  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0400978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  35.32 
 
 		 606 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.03 
 
 		 418 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 363 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.12 
 
 		 389 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 415 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20620  ABC-type branched-chain amino acid transport system, permease component  32.76 
 
 		 439 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3027  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal  0.739943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.74 
 
 		 418 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.74 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  32.74 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>