96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2210 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  69.97 
 
 		 1132 aa  1294    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  50.86 
 
 		 983 aa  688    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  63.92 
 
 		 705 aa  865    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  94.34 
 
 		 702 aa  1338    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 913 aa  1873    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  67.54 
 
 		 903 aa  1251    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  49.86 
 
 		 972 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  69.3 
 
 		 898 aa  1273    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  69.76 
 
 		 1100 aa  1305    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  67.54 
 
 		 903 aa  1251    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  69.64 
 
 		 1130 aa  1284    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  31.51 
 
 		 549 aa  160  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  31.86 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  41.27 
 
 		 291 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  37.41 
 
 		 272 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  41.27 
 
 		 277 aa  102  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  39.42 
 
 		 292 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  39.42 
 
 		 292 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  39.84 
 
 		 278 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  40.62 
 
 		 269 aa  99.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  43.59 
 
 		 279 aa  98.2  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  39.47 
 
 		 291 aa  98.2  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  38.4 
 
 		 286 aa  97.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  34.03 
 
 		 244 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  39.84 
 
 		 264 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  36.49 
 
 		 289 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  38.1 
 
 		 271 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  37.8 
 
 		 286 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  40.48 
 
 		 278 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  35.5 
 
 		 300 aa  95.9  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  32.04 
 
 		 294 aa  95.9  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  37.5 
 
 		 263 aa  95.1  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  37.96 
 
 		 289 aa  94.7  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  34.67 
 
 		 292 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  37.06 
 
 		 276 aa  94.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  38.4 
 
 		 263 aa  94  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  35.8 
 
 		 294 aa  92.8  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  37.69 
 
 		 273 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 		 253 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  34.01 
 
 		 273 aa  92  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  35.92 
 
 		 273 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  37.93 
 
 		 255 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  37.2 
 
 		 250 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  32.28 
 
 		 290 aa  90.9  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  36.3 
 
 		 289 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  42.24 
 
 		 255 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  37.8 
 
 		 298 aa  90.9  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  38.62 
 
 		 250 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  33.95 
 
 		 236 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  38.62 
 
 		 250 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  34.15 
 
 		 294 aa  89.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  38.4 
 
 		 253 aa  88.2  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  37.98 
 
 		 262 aa  88.6  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  36.67 
 
 		 288 aa  87.8  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  38.76 
 
 		 262 aa  87.8  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  39.37 
 
 		 252 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  42.86 
 
 		 237 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  39.84 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  38.03 
 
 		 250 aa  84  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  38.46 
 
 		 251 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  35.97 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  34.96 
 
 		 253 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  33.57 
 
 		 254 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  38.46 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  33.08 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  33.33 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  24.22 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  23.32 
 
 		 161 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  30.08 
 
 		 161 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  21.97 
 
 		 161 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  21.97 
 
 		 161 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  25.52 
 
 		 164 aa  52.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  33.72 
 
 		 132 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  30.11 
 
 		 164 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  32.99 
 
 		 161 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  31.91 
 
 		 161 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  31.91 
 
 		 161 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  27.05 
 
 		 161 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  25.37 
 
 		 173 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  32.56 
 
 		 161 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  37.93 
 
 		 161 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  32.56 
 
 		 161 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  28.68 
 
 		 163 aa  48.1  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  37.18 
 
 		 161 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  37.18 
 
 		 162 aa  47.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  37.18 
 
 		 162 aa  47.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  26.83 
 
 		 161 aa  47.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  35.9 
 
 		 161 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  35.9 
 
 		 161 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  27.84 
 
 		 161 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  35.9 
 
 		 161 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  38.16 
 
 		 161 aa  45.8  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  27.1 
 
 		 172 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  35.9 
 
 		 161 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>