106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4799 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  100 
 
 		 132 aa  270  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  82.58 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  75.57 
 
 		 163 aa  216  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  72.73 
 
 		 161 aa  212  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  72.73 
 
 		 161 aa  207  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  70.45 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  70.45 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  70.45 
 
 		 161 aa  206  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  62.5 
 
 		 164 aa  187  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  58.59 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  53.79 
 
 		 161 aa  163  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  53.91 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  52.34 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  49.22 
 
 		 161 aa  149  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  50.39 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  47.29 
 
 		 161 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  48.09 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  46.51 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  49.22 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  49.22 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  41.35 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  43.51 
 
 		 161 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  40.6 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  42.11 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  40.6 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  41.22 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  41.22 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  45.71 
 
 		 169 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  39.23 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  39.23 
 
 		 162 aa  98.2  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  39.1 
 
 		 161 aa  97.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  36.62 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  44.34 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  41.9 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 173 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  33.8 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  35.29 
 
 		 169 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  35.29 
 
 		 169 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  32.37 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  32.37 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  32.39 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  33.59 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  32.82 
 
 		 172 aa  84.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  40 
 
 		 169 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  36.76 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  33.87 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  31.88 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  32.12 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  31.88 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  31.88 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  40.57 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  39.62 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  34.55 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  30.43 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  29.66 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  30.34 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  37.84 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  28.77 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  29.93 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  28.19 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  29.86 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  27.59 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  27.7 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  27.7 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  30.4 
 
 		 194 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  27.92 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  32.23 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  28.21 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  27.81 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  27.81 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  30.58 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  31.2 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  36.46 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  36.05 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  27.56 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  34.38 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  31.3 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  31.3 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  26.87 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  28.69 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  30 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  30 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  29.13 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  27.27 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  36.14 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  27.56 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  26.45 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  29 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  28.23 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  33.72 
 
 		 913 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  29.41 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  32.53 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  31.4 
 
 		 702 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  28.12 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  23.62 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  24.79 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  23.08 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.63 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  27.17 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  27.17 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>