68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1881 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  72.44 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  44.9 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  51.98 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  48.91 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  51.76 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  53.57 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  53.57 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  44.58 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  47 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  48.44 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  47.74 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  40.67 
 
 		 236 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  39.51 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  40.2 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  41.15 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  42.64 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  41.5 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 247 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  48.94 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  39.59 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  29.24 
 
 		 298 aa  85.9  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  33.12 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  34.29 
 
 		 898 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  34.75 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  30.15 
 
 		 903 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  35.48 
 
 		 549 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  30.15 
 
 		 903 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  33.09 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  39.83 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  34.59 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  34.75 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  32.35 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  33.57 
 
 		 913 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  26.99 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  30.3 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  33.08 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  35.16 
 
 		 1100 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  34.71 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  32.17 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  31.97 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  33.59 
 
 		 702 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  33.61 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  32.77 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  33.61 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  32.82 
 
 		 1130 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  31.97 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  32.81 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  31.97 
 
 		 1132 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  34.19 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  29.45 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  30.71 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  30.33 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  30.95 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  31.71 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  29.82 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  29.03 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  29.17 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  29.37 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  35 
 
 		 983 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  28.95 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  23.96 
 
 		 292 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  23.96 
 
 		 292 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  28.49 
 
 		 972 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  28.46 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  27.42 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  27.61 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  27.13 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>