75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2932 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  81.05 
 
 		 286 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  67.59 
 
 		 292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  67.59 
 
 		 292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  66.44 
 
 		 291 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  62.02 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  56.9 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  52.26 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  50.35 
 
 		 273 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  50.35 
 
 		 273 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  50.69 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  51.21 
 
 		 273 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  48.44 
 
 		 292 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  49.28 
 
 		 277 aa  261  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  44.33 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  45.45 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  46.62 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  47.17 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  44.98 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  42.61 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  43.18 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  40.49 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  40.62 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  41.32 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  36.12 
 
 		 546 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  35.74 
 
 		 549 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  39.8 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  35.71 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  34.13 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  44.64 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  41.86 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  38.51 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  36.87 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  38.67 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  38.67 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  37.58 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  37.96 
 
 		 1132 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  38.24 
 
 		 898 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  37.23 
 
 		 1130 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  40.43 
 
 		 247 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  36.03 
 
 		 903 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  36.03 
 
 		 903 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  35.77 
 
 		 1100 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  37.8 
 
 		 913 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  37.8 
 
 		 702 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  36.5 
 
 		 705 aa  96.3  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  37.86 
 
 		 247 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  37.96 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  33.56 
 
 		 983 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  36.03 
 
 		 972 aa  89.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  34.31 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  34.29 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  35.04 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  36.52 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  33.58 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  35.21 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  31.5 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  31.21 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  33.61 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  28.69 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  33.9 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  33.9 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.95 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  29.17 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.95 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  29.03 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  28.12 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  26.47 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.55 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1693  CpcD phycobilisome linker domain protein  43.86 
 
 		 76 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.268965 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  44.64 
 
 		 403 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 439 aa  45.8  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.27 
 
 		 440 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3042  CpcD phycobilisome linker domain protein  42.37 
 
 		 78 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  42.37 
 
 		 78 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>