68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1003 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  59.44 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  44.9 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  44.84 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  47.57 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  44.57 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  49.67 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  49.67 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  51.72 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  47.85 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  47.59 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  47.97 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  45.45 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  38.5 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  40.37 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  43.06 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  41.89 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  37.31 
 
 		 247 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  40.54 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  42.66 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  37.3 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  33.06 
 
 		 903 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  33.06 
 
 		 903 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  32.86 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  31.78 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  33.88 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  36.97 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 913 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  32 
 
 		 1132 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  32.8 
 
 		 1130 aa  66.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 702 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 546 aa  66.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  32.52 
 
 		 898 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  31.06 
 
 		 1100 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  26.98 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  24.66 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  32.23 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  31.36 
 
 		 983 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  33.04 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  31.43 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  29.91 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  28.66 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  28.66 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  30 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  27.39 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  27.39 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  31.3 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  33.9 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  27.34 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  26.6 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  30.7 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  27.04 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  34.35 
 
 		 972 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  27.16 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  32.2 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  29.82 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  26.47 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  30.14 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  27.21 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  27.61 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  29.57 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  29.57 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  27.01 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  26.32 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  27.03 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  26.9 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  28.7 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  26 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>