68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5725 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  79.04 
 
 		 291 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  69.52 
 
 		 289 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  57.24 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  54.24 
 
 		 294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  48.44 
 
 		 286 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  49.49 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  49.49 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  48.62 
 
 		 291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  47.54 
 
 		 286 aa  244  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  46.6 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  44.25 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  43.25 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  42.36 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  46.21 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  41.9 
 
 		 273 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  41.55 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  41.03 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  41.24 
 
 		 277 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  41.46 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  44.04 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  38.11 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  38.6 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  41.52 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  40.37 
 
 		 549 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  39.56 
 
 		 546 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  34.35 
 
 		 244 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  41.1 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  38.61 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  44.44 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  44.83 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  40.13 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  38.82 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  37.77 
 
 		 1132 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  41.56 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  39.07 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  40.69 
 
 		 247 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  43.08 
 
 		 898 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  42.07 
 
 		 247 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  34.67 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  36.59 
 
 		 1130 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  39.13 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  39.57 
 
 		 1100 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  36.23 
 
 		 276 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  37.41 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 		 903 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 		 903 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  37.93 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  37.75 
 
 		 983 aa  96.3  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  37.68 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  43.44 
 
 		 705 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  34.67 
 
 		 913 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  38.1 
 
 		 702 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  38.57 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  37.1 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  36.13 
 
 		 972 aa  89.7  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  32.79 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  33.61 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  37.29 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  30.83 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  33.59 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  33.59 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  33.9 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  28.75 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.3 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  30.08 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  29.57 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  27.34 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>