68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2196 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  50.36 
 
 		 1132 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  50.29 
 
 		 1130 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  48.77 
 
 		 903 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  48.44 
 
 		 1100 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  49.35 
 
 		 898 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  48.63 
 
 		 903 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  50.86 
 
 		 913 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  49.72 
 
 		 702 aa  682    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  53.14 
 
 		 705 aa  713    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  100 
 
 		 983 aa  1987    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  73.64 
 
 		 972 aa  1420    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  28.54 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  26.33 
 
 		 546 aa  126  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  38.18 
 
 		 300 aa  103  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  41.96 
 
 		 292 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  41.96 
 
 		 292 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  43.9 
 
 		 289 aa  101  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  41.61 
 
 		 271 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  37.34 
 
 		 272 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  38.1 
 
 		 291 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  42.37 
 
 		 294 aa  98.6  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  34.57 
 
 		 255 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  39.16 
 
 		 291 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  37.93 
 
 		 255 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  37.75 
 
 		 292 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  37.88 
 
 		 298 aa  96.3  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  39.72 
 
 		 273 aa  95.1  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  37.58 
 
 		 264 aa  94.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  35.8 
 
 		 294 aa  92  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  35.71 
 
 		 286 aa  91.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  38.4 
 
 		 269 aa  90.9  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  33.56 
 
 		 286 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  34.69 
 
 		 289 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  32.91 
 
 		 289 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  35.62 
 
 		 277 aa  89.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  38.98 
 
 		 288 aa  89.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  34.32 
 
 		 244 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  36.49 
 
 		 273 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  36.49 
 
 		 273 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  35.62 
 
 		 278 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  32.91 
 
 		 294 aa  86.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  36.43 
 
 		 278 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  35.86 
 
 		 250 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  39.17 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  35.9 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  36.75 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  33.09 
 
 		 276 aa  80.1  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  38.28 
 
 		 252 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  33.92 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  34.45 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  37.29 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  35.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  35.29 
 
 		 262 aa  77.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  35.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  34.42 
 
 		 247 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  35.04 
 
 		 250 aa  75.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  34.31 
 
 		 237 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  32.82 
 
 		 253 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.82 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  31.5 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  30.53 
 
 		 244 aa  63.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  31.36 
 
 		 254 aa  63.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  35 
 
 		 254 aa  62.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  28.8 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>