68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1353 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  82 
 
 		 250 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  67.6 
 
 		 251 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  67.73 
 
 		 250 aa  333  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  60.08 
 
 		 252 aa  301  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  50.39 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  51.07 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  61.98 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  51.22 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  41.63 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  42.8 
 
 		 253 aa  194  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  53.57 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  51.52 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  51.58 
 
 		 276 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  42.97 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  44.49 
 
 		 247 aa  184  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  51.06 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  49.67 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  46.93 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  44.33 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  37.58 
 
 		 1100 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  36.49 
 
 		 549 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  40.17 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 546 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  36.49 
 
 		 898 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  38.62 
 
 		 913 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  33.54 
 
 		 903 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  33.54 
 
 		 903 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  30.04 
 
 		 1130 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  38.82 
 
 		 1132 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  36 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  29.36 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  35 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  38.71 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  32.64 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  34.56 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  35.56 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  33.59 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  37.6 
 
 		 702 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  38.14 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  37.6 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  38.1 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  35.25 
 
 		 972 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  37.7 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  35.94 
 
 		 983 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  37.61 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  37.61 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  37.7 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  35.94 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  34.48 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  36.07 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  36.07 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  31.91 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  34.43 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  34.43 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  34.64 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  32.5 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  34.71 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  32.77 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  34.75 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  33.9 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  33.05 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  33.62 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  32 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>