69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4104 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  72.16 
 
 		 291 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  69.52 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  56.04 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  55.03 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  48.44 
 
 		 291 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  47.75 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  47.75 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  45.45 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  44.67 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  43.77 
 
 		 286 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  43.66 
 
 		 273 aa  219  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  42.2 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  40.21 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  40.62 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  41.76 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  39.93 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  39.58 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  39.52 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  38.89 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  42.09 
 
 		 255 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  37.59 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  37.59 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  35.16 
 
 		 546 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  35.16 
 
 		 549 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  34.81 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  36.47 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  40.11 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  38.36 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  32.16 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  35.26 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  38.64 
 
 		 898 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 1100 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  35.81 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  36.14 
 
 		 1132 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  38.36 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  32.14 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  37.78 
 
 		 1130 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  33.77 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  36.3 
 
 		 903 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  36.3 
 
 		 903 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  40 
 
 		 705 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  33.77 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  36.3 
 
 		 913 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  36.3 
 
 		 702 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  32.91 
 
 		 983 aa  89  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  38.52 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  34.78 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  32.12 
 
 		 972 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  37.7 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  36.52 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  34 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  34.21 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  38.4 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  34.65 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  31.97 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  35.71 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  31.97 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  32.79 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  31.97 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  33.33 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.79 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  32.52 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  32 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  32 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  31.36 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  33.6 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  28.7 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3078  CpcD phycobilisome linker domain protein  43.33 
 
 		 78 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>