68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3508 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  82 
 
 		 250 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  82 
 
 		 250 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  70 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  66.14 
 
 		 250 aa  332  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  63.41 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  51.16 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  50.39 
 
 		 262 aa  248  9e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  61.58 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  52.2 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  44.36 
 
 		 253 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  43.19 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  51.76 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  53.89 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  53.4 
 
 		 247 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  52.11 
 
 		 276 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  45.31 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  52.66 
 
 		 279 aa  185  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  49.72 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  47.57 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  47.42 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  41.48 
 
 		 1132 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  35.81 
 
 		 898 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  36.91 
 
 		 1100 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  41.53 
 
 		 549 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  31 
 
 		 1130 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  37.2 
 
 		 913 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  39.39 
 
 		 702 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  35.57 
 
 		 903 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  35.57 
 
 		 903 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  37.6 
 
 		 298 aa  89  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  40.34 
 
 		 546 aa  88.6  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  37.89 
 
 		 300 aa  88.6  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  34.03 
 
 		 705 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  36.62 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  35.86 
 
 		 983 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  33.11 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  38.98 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  37.5 
 
 		 972 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  36.13 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  34 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  38.98 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  33.9 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  35.66 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  36.75 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  30.52 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  36.75 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  35.71 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  31.11 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  38.66 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  34.06 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  36.64 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  34.62 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  34.45 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  31.29 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  33.57 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  35.59 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  35.59 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  34.19 
 
 		 288 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  31.29 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  31.21 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  30.89 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  31.93 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  34.45 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  31.09 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  30.53 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  31.36 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  31.9 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>