68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1871 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 300 aa  621  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  48.66 
 
 		 290 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  58.16 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  51.8 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  46.63 
 
 		 546 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  47.59 
 
 		 549 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  43 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  46.15 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  36.71 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  36.71 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  45.11 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  40.26 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  38.76 
 
 		 253 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  39.88 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  41.33 
 
 		 264 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  41.14 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  41.14 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  36.26 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  37.25 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  37.57 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  37.89 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  38.56 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  38.46 
 
 		 277 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  40.28 
 
 		 244 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  38.75 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  37.58 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  41.28 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  39.33 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  39.07 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  39.74 
 
 		 898 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  38 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  40.28 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  38.99 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  35.91 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  38.18 
 
 		 983 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  42.62 
 
 		 972 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  35.47 
 
 		 903 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  33.77 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  43.44 
 
 		 705 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  35.47 
 
 		 903 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  37.06 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  38.97 
 
 		 1100 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  39.33 
 
 		 1132 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  39.71 
 
 		 1130 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  35.5 
 
 		 913 aa  95.9  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  44.44 
 
 		 252 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 702 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  38.89 
 
 		 247 aa  92.4  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  34.27 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  46.92 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  37.89 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  42.11 
 
 		 237 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  36.18 
 
 		 253 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  42.61 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  36.84 
 
 		 250 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  38.6 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  41.46 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  37.28 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  44.17 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  40.5 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  38.58 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  37.41 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  39.71 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  39.83 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  38.46 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  32.86 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>