68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1884 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  81.24 
 
 		 549 aa  933    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 546 aa  1125    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  48.4 
 
 		 255 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  47.37 
 
 		 255 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  46.9 
 
 		 298 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  43.06 
 
 		 288 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  46.61 
 
 		 294 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  46.63 
 
 		 300 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  43.8 
 
 		 253 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  42.63 
 
 		 273 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  42.44 
 
 		 273 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  41.53 
 
 		 278 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  39.56 
 
 		 292 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  32.85 
 
 		 1132 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  41.18 
 
 		 273 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  44.62 
 
 		 290 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  39.11 
 
 		 272 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  40.15 
 
 		 264 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  35.16 
 
 		 289 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  33.43 
 
 		 1100 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  39.11 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  36.29 
 
 		 286 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  32.18 
 
 		 1130 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  38.52 
 
 		 291 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  29.51 
 
 		 903 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  33.15 
 
 		 898 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  29.27 
 
 		 903 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  31.86 
 
 		 913 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  36.12 
 
 		 286 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  38.46 
 
 		 244 aa  157  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  39.02 
 
 		 289 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  36.61 
 
 		 292 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  36.61 
 
 		 292 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  35.36 
 
 		 291 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  42.54 
 
 		 269 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  37.71 
 
 		 244 aa  150  7e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  35.27 
 
 		 277 aa  147  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  37.27 
 
 		 294 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  33.85 
 
 		 289 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  38.15 
 
 		 294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  26.34 
 
 		 705 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  37.6 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  27.64 
 
 		 702 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  37.74 
 
 		 263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  38.46 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  26.33 
 
 		 983 aa  127  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  40.85 
 
 		 247 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  30.4 
 
 		 972 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  40.85 
 
 		 247 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  39.86 
 
 		 237 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  39.04 
 
 		 253 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  39.04 
 
 		 253 aa  97.8  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 250 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 250 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  40.87 
 
 		 279 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  35.21 
 
 		 276 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  39.71 
 
 		 251 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  40.34 
 
 		 250 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  39.13 
 
 		 250 aa  88.6  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 244 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  29.65 
 
 		 252 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  38.35 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  34.85 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  34.09 
 
 		 262 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  32.03 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  34.59 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  36.8 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  33.33 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>