68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0999 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 
278 aa  564  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  58.71 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  52.63 
 
 
253 aa  251  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  46.1 
 
 
272 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  46.47 
 
 
271 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  50.81 
 
 
255 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  48.99 
 
 
255 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  43.17 
 
 
273 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  43.64 
 
 
292 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  43.64 
 
 
292 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  45.83 
 
 
291 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  42.61 
 
 
286 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  43.4 
 
 
289 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  42.34 
 
 
273 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  41.97 
 
 
273 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  41.46 
 
 
292 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  39.65 
 
 
289 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  39.52 
 
 
289 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  41.34 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  38.57 
 
 
291 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  41.92 
 
 
278 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  39.93 
 
 
277 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  40.84 
 
 
549 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  38.16 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  41.53 
 
 
546 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  35.96 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  37.07 
 
 
244 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  37.23 
 
 
244 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  40.91 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  42.21 
 
 
263 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  39.2 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  40.91 
 
 
298 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  43.48 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  41.54 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  38.75 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  41.32 
 
 
1132 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  35.1 
 
 
898 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  41.54 
 
 
705 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  40.83 
 
 
253 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  39.13 
 
 
247 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  35.09 
 
 
237 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  40.65 
 
 
247 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  38.24 
 
 
290 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  39.84 
 
 
913 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  39.84 
 
 
702 aa  99.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  31.79 
 
 
903 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  31.79 
 
 
903 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  37.96 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  35.97 
 
 
1100 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  38.85 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  41.8 
 
 
1130 aa  93.2  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  38.21 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  40.71 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  36.43 
 
 
983 aa  88.6  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  36.64 
 
 
972 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  36 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  33.76 
 
 
251 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  33.87 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  37.93 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  35.66 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.77 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  33.91 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  29.32 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  25 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.17 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  27.39 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>