68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2937 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  76.11 
 
 		 247 aa  401  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  54.58 
 
 		 276 aa  280  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  56.72 
 
 		 279 aa  274  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  54.37 
 
 		 253 aa  261  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  54.55 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  64.17 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  49.19 
 
 		 252 aa  218  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  45.31 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  43.44 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  42.97 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  42.97 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  41.39 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  52.44 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  48.96 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  45.36 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  43.81 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  41.4 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  39.59 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  43.66 
 
 		 549 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  38.02 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  39.78 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  40.85 
 
 		 546 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  47.54 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  47.54 
 
 		 292 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  42.07 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  36.47 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  43.09 
 
 		 286 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  45.08 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  41.13 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  40.65 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  40.54 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  43.33 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  40.43 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  43.9 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  42.15 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  41.6 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  39.42 
 
 		 1132 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  34.97 
 
 		 898 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  40.58 
 
 		 294 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  43.2 
 
 		 278 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  40.32 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  35.37 
 
 		 903 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  45.08 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  35.37 
 
 		 903 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  34.62 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  36.88 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  36.23 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  46.92 
 
 		 300 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  35.46 
 
 		 1100 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  31.25 
 
 		 1130 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  39.2 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  42.98 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  37.7 
 
 		 289 aa  85.1  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 913 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 702 aa  82  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  36.59 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  34.45 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  31.29 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  36.13 
 
 		 972 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  34.15 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  34.42 
 
 		 983 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  31.08 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>