69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1050 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  67.12 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  67.12 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  63.7 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  57.59 
 
 		 289 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  56.9 
 
 		 286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  55.94 
 
 		 286 aa  317  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  50.87 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  49.3 
 
 		 273 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  48.61 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  47.57 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  46.88 
 
 		 273 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  42.96 
 
 		 264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  41.03 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  43.98 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  40.07 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  40.21 
 
 		 289 aa  208  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  39.65 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  42.7 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  38.19 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  40.45 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  42.7 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  38.91 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  36.86 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  36.15 
 
 		 549 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  33.85 
 
 		 546 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  41.94 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  37.45 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  29.23 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  36.06 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  36.7 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  38.75 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  38.02 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  41.28 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  45.97 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  33.33 
 
 		 247 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  43.9 
 
 		 705 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  35.26 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  43.41 
 
 		 903 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  43.9 
 
 		 983 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  43.41 
 
 		 903 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  36.08 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  42.97 
 
 		 1130 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  39.1 
 
 		 898 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  44.63 
 
 		 1132 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  40.16 
 
 		 237 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  38.28 
 
 		 1100 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  36.09 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  43.8 
 
 		 253 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  37.96 
 
 		 913 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 702 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  40.65 
 
 		 972 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  41.32 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  38.1 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  38.02 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  39.34 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  38.21 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  34.23 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  38.14 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  38.98 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  38.14 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  38.52 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  34.92 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.28 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  30.33 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.71 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.69 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  26.6 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.76 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>