72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2095 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  74.5 
 
 
1132 aa  1377    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  72.96 
 
 
1130 aa  1350    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 
903 aa  1847    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  73.06 
 
 
1100 aa  1358    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  84.72 
 
 
898 aa  1553    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  99.89 
 
 
903 aa  1846    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  67.76 
 
 
913 aa  1261    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  66.39 
 
 
702 aa  944    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  46.26 
 
 
972 aa  637    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  65.94 
 
 
705 aa  888    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  49.06 
 
 
983 aa  652    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  28.64 
 
 
549 aa  164  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  29.51 
 
 
546 aa  161  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 
277 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  42.96 
 
 
294 aa  105  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  37.96 
 
 
286 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  42.96 
 
 
289 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  32.58 
 
 
272 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 
291 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  40.94 
 
 
291 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  43.75 
 
 
289 aa  100  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 
292 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 
292 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  31.82 
 
 
273 aa  100  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  41.18 
 
 
269 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  38 
 
 
300 aa  99.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  35.76 
 
 
271 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  36.3 
 
 
289 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  31.79 
 
 
278 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 
292 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  36.03 
 
 
286 aa  99  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  36.17 
 
 
298 aa  98.2  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  34.53 
 
 
288 aa  97.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  40.98 
 
 
255 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  37.06 
 
 
294 aa  96.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  38.89 
 
 
278 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  34.76 
 
 
276 aa  95.5  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  35.04 
 
 
294 aa  94.7  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  37.09 
 
 
236 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  36.05 
 
 
244 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  39.37 
 
 
252 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  34.06 
 
 
273 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  35.98 
 
 
247 aa  92  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  34.06 
 
 
273 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  35.59 
 
 
263 aa  91.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  35.37 
 
 
247 aa  91.3  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  36.96 
 
 
290 aa  90.9  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  30.63 
 
 
264 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  35.57 
 
 
250 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  34.75 
 
 
263 aa  90.1  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  38.1 
 
 
237 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  33.54 
 
 
250 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  33.54 
 
 
250 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  41.03 
 
 
279 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  36.96 
 
 
251 aa  89  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  36.59 
 
 
253 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  35.77 
 
 
253 aa  87.8  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  37.5 
 
 
262 aa  87.8  8e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  28.11 
 
 
253 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  36.97 
 
 
262 aa  86.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  36.21 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  36.75 
 
 
250 aa  83.2  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.15 
 
 
254 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  34.64 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  35.25 
 
 
252 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  34.19 
 
 
248 aa  73.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  34.59 
 
 
244 aa  73.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  33.06 
 
 
254 aa  70.5  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  41.38 
 
 
161 aa  52.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  34.09 
 
 
161 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  34.09 
 
 
161 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  36.59 
 
 
161 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>