68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2927 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  100 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  64.29 
 
 
277 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  47.04 
 
 
292 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  47.04 
 
 
292 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  45.42 
 
 
271 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  46.62 
 
 
286 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  46.84 
 
 
291 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  44.44 
 
 
272 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  44.23 
 
 
273 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  45.09 
 
 
273 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  45.09 
 
 
273 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  45.28 
 
 
286 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  43.98 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  42.69 
 
 
264 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  40.42 
 
 
289 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  41.92 
 
 
278 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  40.15 
 
 
253 aa  188  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  38.6 
 
 
292 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  38.85 
 
 
255 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  39.62 
 
 
255 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  35.66 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  34.81 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  34.23 
 
 
294 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  33.85 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  35.34 
 
 
244 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  37.6 
 
 
546 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  36.78 
 
 
549 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  42.55 
 
 
294 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  34.8 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  41.21 
 
 
288 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  40.26 
 
 
298 aa  122  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  40.26 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  39.16 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  35.4 
 
 
269 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  42.06 
 
 
898 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  41.61 
 
 
705 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  40.48 
 
 
1100 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  36.42 
 
 
263 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  40.48 
 
 
913 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  38.89 
 
 
903 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  38.89 
 
 
903 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  35.76 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  40.48 
 
 
702 aa  95.5  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  43.2 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  39.44 
 
 
1132 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  38.16 
 
 
1130 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  39.68 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  40.65 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  35.62 
 
 
983 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  36 
 
 
972 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  36.07 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  34.43 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  40.87 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  36 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  34.65 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  32.79 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  34.43 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  34.64 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  34.64 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  34.43 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  35.43 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  34.45 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  30.46 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  30 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.23 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  27.13 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  29.31 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  27.03 
 
 
254 aa  48.9  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>