69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1049 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  58.97 
 
 		 272 aa  341  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  60.22 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  59.12 
 
 		 273 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  54.95 
 
 		 271 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  53.95 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  51.88 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  51.88 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  51.21 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  51.03 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  49.3 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  47.37 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  46.1 
 
 		 277 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  44.25 
 
 		 292 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  43.91 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  43.17 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  44.23 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  46.43 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  45.85 
 
 		 255 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  46.27 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  43.66 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  41.26 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  39.45 
 
 		 294 aa  182  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  39.24 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  42.63 
 
 		 546 aa  178  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  41.6 
 
 		 549 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  34.87 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  41.92 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  33.85 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  41.62 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  45.14 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  39.88 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  38.89 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  43.94 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  41.84 
 
 		 1132 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  36.84 
 
 		 898 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  36.24 
 
 		 247 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  36.47 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  35.42 
 
 		 1100 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  31.82 
 
 		 903 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  31.82 
 
 		 903 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  34 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  34 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  38.93 
 
 		 1130 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  35.17 
 
 		 237 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  39.72 
 
 		 983 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  36.72 
 
 		 705 aa  92.4  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  36.69 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  35.17 
 
 		 253 aa  92.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  35 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  35.42 
 
 		 276 aa  92  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  34.01 
 
 		 913 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  34.69 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  31.48 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  33.79 
 
 		 253 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  39.5 
 
 		 972 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  33.11 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  34.43 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  36 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  36 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  38.14 
 
 		 702 aa  82.8  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  33.11 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  30.43 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  26.99 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  32.7 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  29.27 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  27.64 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  26.98 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1761  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.381589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>