68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1699 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  59.17 
 
 
251 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  61.05 
 
 
252 aa  239  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  61.98 
 
 
250 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  61.58 
 
 
250 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  61.98 
 
 
250 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  57.98 
 
 
236 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  59.47 
 
 
250 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  52.85 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  52.33 
 
 
279 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  51.04 
 
 
247 aa  185  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  48.96 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  42.08 
 
 
237 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  45.31 
 
 
253 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  46 
 
 
262 aa  164  8e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  44.83 
 
 
262 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  44.56 
 
 
253 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  41.62 
 
 
252 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  41.15 
 
 
254 aa  131  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  36.44 
 
 
248 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  41.89 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  45.6 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  36.81 
 
 
1100 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  34.03 
 
 
913 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  39.68 
 
 
1132 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  34.27 
 
 
898 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  36.05 
 
 
903 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  32.35 
 
 
1130 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  36.05 
 
 
903 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  36.69 
 
 
273 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  31.28 
 
 
705 aa  92  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  37.1 
 
 
292 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  34.32 
 
 
983 aa  89.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  37.04 
 
 
549 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  36.36 
 
 
294 aa  88.2  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  38.4 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  37.01 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 
546 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  39.1 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  36 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  33.73 
 
 
972 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  41.46 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  38.21 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  36.17 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  35.46 
 
 
273 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  37.9 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  35.46 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  35.94 
 
 
702 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  37.9 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  34.85 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  34.75 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  34.4 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  34.65 
 
 
289 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  31.71 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  34.97 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  34.06 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  34.45 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  31.71 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  31.5 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  34.65 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  32.28 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  31.43 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  35.77 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  32.33 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  32.33 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  34.75 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  34.62 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  31.06 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>