68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2939 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  83.4 
 
 
253 aa  448  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  67.19 
 
 
237 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  54.37 
 
 
247 aa  261  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  66.67 
 
 
247 aa  252  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  47.67 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  50.63 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  44.57 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  43.41 
 
 
251 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  43.19 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  41.63 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  41.63 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  41.7 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  47.31 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  44.56 
 
 
244 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  37.98 
 
 
262 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  44.33 
 
 
252 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  35.36 
 
 
262 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  39.51 
 
 
254 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  40.59 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  40.37 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  40.83 
 
 
278 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  39.13 
 
 
292 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  39.73 
 
 
549 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  39.04 
 
 
546 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  43.44 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  43.44 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  37.69 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  35.75 
 
 
291 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  43.8 
 
 
289 aa  95.9  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  34.18 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  39.84 
 
 
898 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  35.17 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  34.81 
 
 
298 aa  92.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  37.21 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  40.8 
 
 
1100 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 
913 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 
702 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  37.23 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  35.51 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  35.71 
 
 
1132 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  39.34 
 
 
255 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  36.59 
 
 
903 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  35.71 
 
 
1130 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  36.59 
 
 
903 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  40.8 
 
 
705 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  34.31 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  34.15 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  35 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  44.17 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  35.46 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  34 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  35.83 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  36.07 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  35.71 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  35.9 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  39.17 
 
 
983 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  31.03 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  35.9 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  34.96 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  35.9 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  37.21 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  34.48 
 
 
972 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  30.51 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  34.75 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  34.17 
 
 
294 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  34.19 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  28.57 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>