109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3635 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  91.3 
 
 		 161 aa  297  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  79.5 
 
 		 161 aa  277  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  73.12 
 
 		 163 aa  258  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  72.05 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  73.29 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  72.05 
 
 		 161 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  61.88 
 
 		 164 aa  226  8e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  60 
 
 		 164 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  72.73 
 
 		 132 aa  212  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  55 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  54.04 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  51.88 
 
 		 161 aa  187  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  50.62 
 
 		 161 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  50.31 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  49.07 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  49.38 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  47.2 
 
 		 161 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  50 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  50 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  36.71 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  37.74 
 
 		 161 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  36.48 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  37.11 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  37.74 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  37.74 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  34.39 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  33.76 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  35.33 
 
 		 169 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  34.53 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  34.59 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  34.59 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  31.58 
 
 		 173 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  33.33 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  33.8 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  33.8 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  34.06 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  34.06 
 
 		 172 aa  97.1  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  33.09 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  35.11 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  33.58 
 
 		 172 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  35.88 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  35.11 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  33.33 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  30.86 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  34.78 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  31.69 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  31.07 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  31.45 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  31.06 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  29.38 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  33.33 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  29.71 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  29.61 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  33.1 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  36.52 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  29.63 
 
 		 172 aa  84.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  29.65 
 
 		 177 aa  84  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  28.65 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  32.82 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  27.68 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  32.1 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  30.3 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  29.75 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  27.32 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  29.01 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  27.32 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  26.11 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  29.22 
 
 		 194 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  33.08 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  29.85 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  30.86 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  29.63 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  24.44 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  24.44 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  27.22 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  25.14 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.22 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  29.27 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  27.78 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  27.16 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  29.45 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1894  C-phycoerythrin class II alpha chain  27.54 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  29.49 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  27.78 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  27.78 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  27.16 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1048  phycocyanin, alpha subunit  28.4 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.348249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1053  phycocyanin, alpha subunit  28.4 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.607744  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25.31 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  25.93 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  25.93 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  26.99 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  24.69 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  23.46 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  26.36 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  23.46 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  21.92 
 
 		 702 aa  53.9  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0802  allophycocyanin alpha chain-like  27.45 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.764861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>