108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0807 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 169 aa  346  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  100 
 
 		 169 aa  346  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  82.84 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  76.33 
 
 		 169 aa  275  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  73.37 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  69.23 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  64.46 
 
 		 169 aa  240  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  68.67 
 
 		 169 aa  233  9e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.97 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  54.39 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  56.05 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  56.05 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  56.05 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  54.78 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  54.14 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  49.4 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  52.56 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  53.55 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  53.55 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  53.55 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  47.01 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  45.07 
 
 		 173 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  45.83 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  43.06 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  45.07 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  42.57 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  43.75 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  43.75 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  39.07 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  43.24 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  45.59 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  45.52 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  43.7 
 
 		 179 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  40.29 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  39.07 
 
 		 161 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  41.5 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  38.41 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  39.74 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  39.74 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  38.1 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  40 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  38.89 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  40.97 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  38.89 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  36.02 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  42.96 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  38.82 
 
 		 181 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  38.64 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  38.64 
 
 		 161 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  40.14 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  39.26 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  40.74 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  44.36 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  40.74 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  35.17 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  33.33 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  40 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  38.41 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  35.37 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  35.37 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  34.76 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  34.03 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  35 
 
 		 164 aa  97.4  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  35.11 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  29.81 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  35.29 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1902  C-phycoerythrin class I alpha chain  31.62 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  30.97 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  30.53 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  31.82 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  29.13 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0296  phycocyanin  29.71 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3488  phycocyanin subunit alpha  26.38 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0427  C-phycoerythrin class I alpha chain  26.22 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0528706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  29.59 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2926  phycobilisome protein  29.71 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  22.64 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4515  Phycobilisome protein  26.83 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.915449 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  24.69 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  23.64 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5732  Phycobilisome protein  27.44 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0420  phycocyanin, alpha subunit  25.15 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161812  decreased coverage  0.00995001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1696  phycocyanin, alpha subunit  24.54 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0555284 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1909  phycocyanin, alpha subunit  25.15 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0996  phycobilisome protein  25.61 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.388342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0983  phycobilisome protein  26.75 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  23.31 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0160  phycocyanin, alpha subunit  23.93 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148087 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  26.19 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03331  hypothetical protein  24.84 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0434  C-phycoerythrin class II alpha chain  24.29 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22371  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  28.26 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4420  Phycobilisome protein  26.17 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1672  phycoerythrin class III alpha chain CpeA  24.46 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.339524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03861  phycobilisome protein (phycoerythrin, alpha-subunit)  24.46 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235935  normal  0.0388736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2872  phycocyanin, alpha subunit  21.6 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0590768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5048  phycocyanin, alpha subunit  25.64 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3075  phycocyanin, alpha subunit  24.54 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3045  phycocyanin, alpha subunit  24.54 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>